More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2721 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 132 aa  263  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  58.1 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  63.53 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4286  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30031  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  42.7 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  38.71 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  49.28 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  37.93 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  39.77 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  36.67 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  32.04 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  37.21 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  37.62 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  35.78 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  31.73 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  38.38 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  40.23 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  37.37 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  32.99 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2354  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000229656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0116  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  25 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 		 102 aa  57  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  39.77 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  32.98 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  36.99 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  38.36 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  30.43 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  30.43 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  32.95 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  34.57 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  42.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 235 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 235 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>