More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1363 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
227 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  57.97 
 
 
221 aa  236  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  47.6 
 
 
221 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
223 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 
224 aa  191  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
224 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
224 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
230 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
224 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
224 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
224 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  42.79 
 
 
233 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  43.6 
 
 
228 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  43.27 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  42.06 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
226 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  43.54 
 
 
222 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  46.12 
 
 
221 aa  168  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  43.41 
 
 
235 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  43.41 
 
 
235 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  43.41 
 
 
235 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  41.55 
 
 
221 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  45.63 
 
 
221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 
226 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  42.44 
 
 
218 aa  161  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  44.66 
 
 
221 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  40.89 
 
 
227 aa  160  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
223 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
222 aa  158  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  43.28 
 
 
223 aa  158  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
219 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
220 aa  152  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
253 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
227 aa  148  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
234 aa  145  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
218 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
226 aa  142  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  37.5 
 
 
184 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  37.43 
 
 
189 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  37.56 
 
 
219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  37.67 
 
 
232 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  52.21 
 
 
124 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  52.21 
 
 
124 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 
114 aa  91.7  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  44.78 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  40 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  40.7 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
155 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  40 
 
 
155 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  40 
 
 
155 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  40 
 
 
155 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
155 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  40 
 
 
155 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.25 
 
 
550 aa  65.9  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
568 aa  65.1  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  30.14 
 
 
390 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186232  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 
106 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  38.38 
 
 
174 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
145 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 
141 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 
121 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  41.86 
 
 
118 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 
470 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  34.58 
 
 
138 aa  62.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38.2 
 
 
142 aa  62.4  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  36.96 
 
 
139 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 
139 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
114 aa  62  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3740  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
124 aa  62  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 
109 aa  62  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
114 aa  62  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 
164 aa  61.6  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
113 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 
107 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  35.96 
 
 
133 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 
131 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
144 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
123 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  29.45 
 
 
390 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  41.05 
 
 
110 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  27.14 
 
 
391 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 
108 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
107 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
122 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  41.05 
 
 
114 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  38.82 
 
 
110 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
107 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
107 aa  60.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  37.63 
 
 
129 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  39.08 
 
 
110 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
142 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 
106 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  30.36 
 
 
133 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  47.06 
 
 
356 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>