168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0872 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
131 aa  273  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  56.25 
 
 
133 aa  154  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  53.12 
 
 
133 aa  153  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  53.12 
 
 
132 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  53.12 
 
 
132 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  47.37 
 
 
241 aa  139  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
145 aa  103  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  36.72 
 
 
144 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  36.75 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  37.39 
 
 
144 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  43.86 
 
 
136 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  40.54 
 
 
136 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  36.7 
 
 
134 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  38.66 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  33.62 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  33.91 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  35.65 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  35.78 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  35.78 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  33.64 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  32.17 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  37.61 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  33.64 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  39.45 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  39.45 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  36.04 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  32.74 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  32.79 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  36.04 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  36.04 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  36.04 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  36.04 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  36.04 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  36.7 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 
155 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  32.67 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  32.11 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 
227 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 
222 aa  60.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
226 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
219 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
233 aa  53.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
253 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 
226 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  30.69 
 
 
222 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  30.84 
 
 
136 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
222 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
223 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  26.04 
 
 
221 aa  50.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  30.11 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  36.56 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  31.62 
 
 
154 aa  50.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
224 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 
227 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 
231 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  29.36 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 
221 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  38.46 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
228 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  31.01 
 
 
432 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  35.4 
 
 
222 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  29.36 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
221 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  31.25 
 
 
221 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0410  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.692094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
224 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
224 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
224 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
224 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
230 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  30.58 
 
 
199 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
227 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  31.58 
 
 
223 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.56 
 
 
393 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
224 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  27.43 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 
218 aa  47.8  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  30.09 
 
 
194 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
189 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  32.26 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  29.25 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
221 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  30.21 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  31.13 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1512  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.766741  normal  0.549953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04680  Rhodanese-like protein  32 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.940144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  32.47 
 
 
252 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.67 
 
 
383 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  28.16 
 
 
218 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>