245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3657 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  100 
 
 
133 aa  277  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  83.33 
 
 
132 aa  243  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  83.33 
 
 
132 aa  243  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  68.42 
 
 
133 aa  202  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  58.14 
 
 
241 aa  164  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  53.12 
 
 
131 aa  153  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 
138 aa  101  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  36.09 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  37.39 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  36.94 
 
 
136 aa  90.1  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  37.07 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  34.26 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  35.65 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  36.97 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  40.52 
 
 
131 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  33.93 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  34.17 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  34.51 
 
 
146 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  38.53 
 
 
141 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  36.29 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  38.53 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  40 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  38.53 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  37.17 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  32.74 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  32.74 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  36.36 
 
 
169 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  33.06 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  34.86 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  38.46 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  38.46 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  38.46 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  38.46 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  35.14 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  35.14 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
227 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 
226 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
233 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  39.33 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
253 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
224 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.33 
 
 
484 aa  54.3  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
222 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  35.23 
 
 
247 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  38.2 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
228 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  37.63 
 
 
172 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
226 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  32.95 
 
 
346 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
221 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 
185 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  32.99 
 
 
164 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  28.45 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
221 aa  50.1  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  35.87 
 
 
377 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
227 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  32.65 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  32.08 
 
 
380 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  37.08 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 
222 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  32.61 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
221 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
226 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  28.7 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  32 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  28.81 
 
 
354 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  34.44 
 
 
369 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  35 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  31.25 
 
 
363 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  28.45 
 
 
221 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  35 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  30.89 
 
 
221 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  32.94 
 
 
252 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
224 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  34.04 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  36 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
224 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
224 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
224 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
230 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  33.68 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
223 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 
218 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
231 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  29.52 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  35 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
170 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>