124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2088 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  346  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  84.67 
 
 		 146 aa  239  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  70.23 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  71.21 
 
 		 139 aa  180  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  59.42 
 
 		 142 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  67.19 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  63.5 
 
 		 166 aa  170  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  71.21 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  71.21 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  57.14 
 
 		 144 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  59.06 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  60.29 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  71.97 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  67.83 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  71.85 
 
 		 139 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  71.85 
 
 		 139 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  57.89 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  56.59 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  56.39 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  64.93 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  64.93 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  64.93 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  64.93 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  64.93 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  64.93 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  56.06 
 
 		 129 aa  138  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  54.89 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  55.95 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  46.96 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 138 aa  94.4  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  36.75 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  30.97 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  31.86 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  32.74 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  35.61 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  35.2 
 
 		 144 aa  62  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.65 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  31.62 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  31.62 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  32.91 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 247 aa  51.2  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  32.22 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 227 aa  50.8  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  34.41 
 
 		 274 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  34.04 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  35.8 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 235 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 235 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 235 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 230 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  32.71 
 
 		 147 aa  48.5  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 221 aa  48.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 227 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  45.33 
 
 		 116 aa  46.6  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 221 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 		 220 aa  45.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  34.57 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  39.08 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 233 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 222 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.88 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 		 480 aa  45.1  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  32.61 
 
 		 112 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 221 aa  44.7  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  33.04 
 
 		 227 aa  44.7  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 253 aa  44.3  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 189 aa  44.3  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  31.52 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  37.5 
 
 		 553 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 569 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  30.34 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  31 
 
 		 122 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.51 
 
 		 106 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 		 549 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  27.64 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 		 549 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  32.91 
 
 		 280 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  38.96 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 555 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 		 467 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>