More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2645 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 147 aa  304  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  43.59 
 
 		 252 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  37.86 
 
 		 169 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  36.8 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  39.81 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  34.75 
 
 		 274 aa  77  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  34.25 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  35.96 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  30.08 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  30.08 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33.67 
 
 		 247 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  28.3 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  28.3 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  31 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  34.07 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  30.91 
 
 		 184 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  33.05 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  28.26 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  33.07 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  27.1 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1223  hypothetical protein  31.31 
 
 		 350 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.468871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01051  hypothetical protein  31.31 
 
 		 350 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2591  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 		 350 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  31.31 
 
 		 350 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  31.31 
 
 		 350 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  25.71 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2217  hypothetical protein  31.31 
 
 		 350 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.598434 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  31.31 
 
 		 350 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  31.31 
 
 		 350 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1267  hypothetical protein  31.31 
 
 		 350 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  27.47 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01059  hypothetical protein  31.31 
 
 		 350 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  31.31 
 
 		 350 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  32.2 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  29.52 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  33.1 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  33.59 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  29.25 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  33.59 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  28.86 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  29.25 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  31.53 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  32.2 
 
 		 301 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  31.43 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2033  hypothetical protein  30.3 
 
 		 350 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  29.52 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  29.66 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1252  hypothetical protein  30.3 
 
 		 350 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.987741 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  28.26 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2261  sulfurtransferase  33.7 
 
 		 271 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  30.97 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  27.89 
 
 		 553 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  29.25 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  34.78 
 
 		 308 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  29.36 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  29.81 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  30.63 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  32.97 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 		 432 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1819  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 		 271 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1560  hypothetical protein  32 
 
 		 355 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.517054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  33.02 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1710  hypothetical protein  32 
 
 		 339 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.351955  hitchhiker  0.000231856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4822  Rhodanese domain protein  33.71 
 
 		 173 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1668  hypothetical protein  32 
 
 		 355 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1569  hypothetical protein  28.44 
 
 		 349 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.626506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  30.84 
 
 		 377 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  28.85 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 219 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0892  Rhodanese domain protein  34.83 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  27.34 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  29.21 
 
 		 221 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  28.38 
 
 		 353 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2519  hypothetical protein  30.3 
 
 		 355 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  31.01 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  32.29 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  30.53 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 226 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 253 aa  50.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 226 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>