More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1560 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1560  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  745    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.517054  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1710  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  712    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.351955  hitchhiker  0.000231856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  87.82 
 
 		 356 aa  666    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1668  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  745    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2519  hypothetical protein  81.38 
 
 		 355 aa  620  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2824  hypothetical protein  80.75 
 
 		 355 aa  615  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.912445  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1608  Rhodanese domain protein  78 
 
 		 353 aa  597  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  74.14 
 
 		 350 aa  565  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2591  Rhodanese domain protein  73.85 
 
 		 350 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894148  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  73.85 
 
 		 350 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  73.85 
 
 		 350 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2033  hypothetical protein  73.56 
 
 		 350 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  73.85 
 
 		 350 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  73.85 
 
 		 350 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1267  hypothetical protein  73.56 
 
 		 350 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01051  hypothetical protein  73.99 
 
 		 350 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01059  hypothetical protein  73.99 
 
 		 350 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1252  hypothetical protein  73.28 
 
 		 350 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.987741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2217  hypothetical protein  73.28 
 
 		 350 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.598434 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1223  hypothetical protein  73.28 
 
 		 350 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1569  hypothetical protein  71.92 
 
 		 349 aa  557  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.626506 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1574  Rhodanese domain protein  72.73 
 
 		 352 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  66.47 
 
 		 346 aa  478  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0454  rhodanese-like domain-containing protein  59.94 
 
 		 324 aa  423  1e-117  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.622343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0905  rhodanese domain-containing protein  54.19 
 
 		 462 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03470  hypothetical protein  53.43 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.909534  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0918  hypothetical protein  33.64 
 
 		 318 aa  178  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0883214 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50174  predicted protein  33.15 
 
 		 906 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1859  Rhodanese domain protein  35.76 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0476  hypothetical protein  35.52 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3631  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  33.87 
 
 		 304 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  33.45 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  33.93 
 
 		 317 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1671  Rhodanese domain protein  32.2 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  33.81 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  34.4 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0916  hypothetical protein  34.68 
 
 		 328 aa  156  7e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  33.55 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  33.45 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  31.21 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  32.18 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  29.36 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  31.15 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  35.02 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  33.45 
 
 		 312 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1635  rhodanese-like protein  33.56 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1989  hypothetical protein  31.77 
 
 		 319 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  33.81 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3469  hypothetical protein  31.44 
 
 		 319 aa  149  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000879156  hitchhiker  0.000000000000171941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1875  hypothetical protein  31.77 
 
 		 319 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1744  hypothetical protein  31.77 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.216312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1719  hypothetical protein  31.77 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1694  hypothetical protein  31.77 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1881  hypothetical protein  31.77 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  32.38 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1916  hypothetical protein  31.77 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000576752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  33.45 
 
 		 312 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0588  hypothetical protein  30.31 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  29.94 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  30.89 
 
 		 323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  31.8 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  31.99 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  33.81 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2691  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.238447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  30.89 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1961  hypothetical protein  31.44 
 
 		 319 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.564375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  33.81 
 
 		 310 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  30.84 
 
 		 334 aa  146  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  30.87 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  30.52 
 
 		 330 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  32.97 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  30.52 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  30.87 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  30.87 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2316  hypothetical protein  33.8 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1434  hypothetical protein  30.38 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0127519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  30.84 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  30.87 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1324  hypothetical protein  29.55 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  30.55 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1464  hypothetical protein  30.54 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0473945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1736  hypothetical protein  30.43 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  32.13 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1395  rhodanese-like protein  31.51 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  31.21 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  31.86 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  31.86 
 
 		 305 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  32.25 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2713  hypothetical protein  31.01 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0311305  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2770  hypothetical protein  31.01 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302608  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  33.98 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3365  hypothetical protein  31.94 
 
 		 297 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  31.6 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  30.67 
 
 		 326 aa  136  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  31.41 
 
 		 311 aa  135  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  31.73 
 
 		 352 aa  135  9e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>