More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2075 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01051  hypothetical protein  99.14 
 
 		 350 aa  726    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2591  Rhodanese domain protein  99.43 
 
 		 350 aa  729    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894148  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1569  hypothetical protein  86.49 
 
 		 349 aa  649    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.626506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1252  hypothetical protein  89.43 
 
 		 350 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.987741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2033  hypothetical protein  90 
 
 		 350 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01059  hypothetical protein  99.14 
 
 		 350 aa  726    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1223  hypothetical protein  90 
 
 		 350 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  734    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  99.14 
 
 		 350 aa  729    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1267  hypothetical protein  90 
 
 		 350 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  98.86 
 
 		 350 aa  728    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  99.14 
 
 		 350 aa  729    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  99.71 
 
 		 350 aa  733    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2217  hypothetical protein  90.29 
 
 		 350 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.598434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  75.71 
 
 		 356 aa  575  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1668  hypothetical protein  74.14 
 
 		 355 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1560  hypothetical protein  74.14 
 
 		 355 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.517054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2824  hypothetical protein  72.78 
 
 		 355 aa  551  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.912445  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1608  Rhodanese domain protein  72.29 
 
 		 353 aa  552  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2519  hypothetical protein  72.99 
 
 		 355 aa  551  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1710  hypothetical protein  73.8 
 
 		 339 aa  537  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.351955  hitchhiker  0.000231856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1574  Rhodanese domain protein  72.62 
 
 		 352 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  62.35 
 
 		 346 aa  458  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0454  rhodanese-like domain-containing protein  59.28 
 
 		 324 aa  406  1.0000000000000001e-112  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.622343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0905  rhodanese domain-containing protein  53.29 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03470  hypothetical protein  51.34 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.909534  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1859  Rhodanese domain protein  36.9 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0476  hypothetical protein  35.29 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3631  hypothetical protein  33.68 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50174  predicted protein  35.49 
 
 		 906 aa  174  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0918  hypothetical protein  33.79 
 
 		 318 aa  172  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0883214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1671  Rhodanese domain protein  33 
 
 		 321 aa  165  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0916  hypothetical protein  33.65 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2691  hypothetical protein  36.49 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.238447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  31.04 
 
 		 350 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  32.15 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  31.23 
 
 		 337 aa  149  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2770  hypothetical protein  32.64 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2713  hypothetical protein  32.64 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0311305  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2316  hypothetical protein  32.02 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1875  hypothetical protein  30.61 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3469  hypothetical protein  30.27 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000879156  hitchhiker  0.000000000000171941 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  31.77 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  32.57 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1744  hypothetical protein  30.61 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.216312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1719  hypothetical protein  30.61 
 
 		 319 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1694  hypothetical protein  30.61 
 
 		 319 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1916  hypothetical protein  30.61 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000576752 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1881  hypothetical protein  30.61 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  29.84 
 
 		 326 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1395  rhodanese-like protein  32.84 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1464  hypothetical protein  30.95 
 
 		 324 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0473945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1989  hypothetical protein  30.61 
 
 		 319 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1635  rhodanese-like protein  33.56 
 
 		 327 aa  146  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  35.51 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  33.07 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  34.62 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  32.86 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  30.79 
 
 		 331 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  35.38 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1961  hypothetical protein  30.27 
 
 		 319 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.564375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  33.57 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  30.26 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0588  hypothetical protein  30.74 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  31.62 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  31.68 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1736  hypothetical protein  29.93 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  29.61 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  32.51 
 
 		 317 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  30.15 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  30.16 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  30.16 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  32.86 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  30.16 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  29.64 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  30.16 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  29.04 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  29.37 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  32.14 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  31.18 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  33.21 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  34.18 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  30.48 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  34.41 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3365  hypothetical protein  33.1 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  32.86 
 
 		 310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  29.84 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  32.14 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  36.88 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  32.05 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1434  hypothetical protein  29.65 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0127519  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  32.05 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  31.45 
 
 		 336 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  33.45 
 
 		 555 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  36.92 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  32.13 
 
 		 332 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  29.52 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>