More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3631 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3631  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  647    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0476  hypothetical protein  58.8 
 
 
328 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217138  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2691  hypothetical protein  61.92 
 
 
312 aa  371  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.238447  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1671  Rhodanese domain protein  57.38 
 
 
321 aa  362  5.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0918  hypothetical protein  56.33 
 
 
318 aa  355  5e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0883214 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2770  hypothetical protein  51.03 
 
 
318 aa  290  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2713  hypothetical protein  51.03 
 
 
318 aa  290  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0311305  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1434  hypothetical protein  47.47 
 
 
328 aa  280  3e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0127519  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0588  hypothetical protein  48.82 
 
 
327 aa  276  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1736  hypothetical protein  49.32 
 
 
319 aa  275  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1961  hypothetical protein  48.64 
 
 
319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.564375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1916  hypothetical protein  48.64 
 
 
319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000576752 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1744  hypothetical protein  48.64 
 
 
319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.216312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1719  hypothetical protein  48.64 
 
 
319 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1694  hypothetical protein  48.64 
 
 
319 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1881  hypothetical protein  48.64 
 
 
319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3469  hypothetical protein  48.64 
 
 
319 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000879156  hitchhiker  0.000000000000171941 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1464  hypothetical protein  46.6 
 
 
324 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0473945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1875  hypothetical protein  48.3 
 
 
319 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1989  hypothetical protein  48.3 
 
 
319 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1324  hypothetical protein  43.87 
 
 
319 aa  259  4e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2316  hypothetical protein  46.23 
 
 
320 aa  255  5e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1859  Rhodanese domain protein  43 
 
 
314 aa  249  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52383  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0916  hypothetical protein  39 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0905  rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 
462 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 
346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  38.52 
 
 
306 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  34.03 
 
 
350 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  34.03 
 
 
350 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01051  hypothetical protein  34.03 
 
 
350 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2591  Rhodanese domain protein  34.03 
 
 
350 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894148  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  34.03 
 
 
350 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01059  hypothetical protein  34.03 
 
 
350 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1569  hypothetical protein  33.56 
 
 
349 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.626506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  33.68 
 
 
350 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  33.68 
 
 
350 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03470  hypothetical protein  35.54 
 
 
343 aa  176  6e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.909534  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  36.86 
 
 
305 aa  175  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  36.65 
 
 
323 aa  176  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  37.6 
 
 
294 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  39.41 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  38.98 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1252  hypothetical protein  33.33 
 
 
350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.987741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1267  hypothetical protein  33.33 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  38.02 
 
 
336 aa  172  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2217  hypothetical protein  33.33 
 
 
350 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.598434 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1223  hypothetical protein  33.33 
 
 
350 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2033  hypothetical protein  33.33 
 
 
350 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  38.62 
 
 
254 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  35.95 
 
 
352 aa  169  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  35.95 
 
 
337 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1608  Rhodanese domain protein  33.11 
 
 
353 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3365  hypothetical protein  34.29 
 
 
297 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  36.86 
 
 
326 aa  168  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  38.94 
 
 
323 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  36.73 
 
 
314 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  34.38 
 
 
356 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  35.12 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  37.44 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  34.84 
 
 
304 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2519  hypothetical protein  34.02 
 
 
355 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  34.84 
 
 
302 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  38.33 
 
 
330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  38.33 
 
 
333 aa  165  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2824  hypothetical protein  33.33 
 
 
355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.912445  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  37.71 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  37.71 
 
 
334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  37.1 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  37.71 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2977  Rhodanese domain protein  34.55 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  40.39 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  37.71 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  37.71 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  37.71 
 
 
331 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  40.39 
 
 
317 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  40.39 
 
 
317 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  37.44 
 
 
330 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29370  predicted sulfurtransferase  31.23 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  36.64 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  37.28 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3404  Rhodanese domain protein  35.13 
 
 
281 aa  162  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  40.89 
 
 
312 aa  162  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  37.32 
 
 
309 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  41 
 
 
310 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0454  rhodanese-like domain-containing protein  30.98 
 
 
324 aa  160  2e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.622343  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  41.5 
 
 
332 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1668  hypothetical protein  33.33 
 
 
355 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  36.13 
 
 
327 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1560  hypothetical protein  33.33 
 
 
355 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.517054  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1710  hypothetical protein  33.33 
 
 
339 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.351955  hitchhiker  0.000231856 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  37 
 
 
333 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1574  Rhodanese domain protein  32.99 
 
 
352 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3153  hypothetical protein  33.21 
 
 
297 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.860693 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  41 
 
 
310 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  38.18 
 
 
310 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  34.64 
 
 
326 aa  159  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  33.07 
 
 
623 aa  159  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  35.62 
 
 
309 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  32.26 
 
 
269 aa  159  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>