289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0588 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0588  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  677    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1434  hypothetical protein  81.99 
 
 
328 aa  564  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0127519  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1324  hypothetical protein  66.77 
 
 
319 aa  467  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3469  hypothetical protein  65.3 
 
 
319 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000879156  hitchhiker  0.000000000000171941 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1961  hypothetical protein  65.3 
 
 
319 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.564375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1464  hypothetical protein  64.15 
 
 
324 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0473945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1736  hypothetical protein  64.35 
 
 
319 aa  435  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1989  hypothetical protein  65.3 
 
 
319 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1744  hypothetical protein  64.98 
 
 
319 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.216312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1875  hypothetical protein  64.98 
 
 
319 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1719  hypothetical protein  64.98 
 
 
319 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1694  hypothetical protein  64.98 
 
 
319 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1881  hypothetical protein  64.98 
 
 
319 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1916  hypothetical protein  64.98 
 
 
319 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000576752 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2770  hypothetical protein  63.34 
 
 
318 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2713  hypothetical protein  63.34 
 
 
318 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0311305  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2316  hypothetical protein  65.48 
 
 
320 aa  423  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1859  Rhodanese domain protein  46.33 
 
 
314 aa  280  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3631  hypothetical protein  48.82 
 
 
312 aa  276  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0476  hypothetical protein  47.47 
 
 
328 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217138  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0918  hypothetical protein  43.1 
 
 
318 aa  258  7e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0883214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1671  Rhodanese domain protein  43.43 
 
 
321 aa  250  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2691  hypothetical protein  43.1 
 
 
312 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.238447  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  39.41 
 
 
308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  39.41 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  38.56 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  40.59 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0916  hypothetical protein  35.62 
 
 
328 aa  194  2e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  39.26 
 
 
322 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  38.75 
 
 
305 aa  192  7e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  39.92 
 
 
254 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  38.98 
 
 
294 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  39.5 
 
 
254 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  39.15 
 
 
323 aa  186  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  34.55 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  37.66 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  37.34 
 
 
302 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  38.2 
 
 
314 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  36.02 
 
 
334 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  37.92 
 
 
305 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  38.91 
 
 
317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  38.91 
 
 
317 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  33.68 
 
 
334 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  37.55 
 
 
309 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  33.68 
 
 
334 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  36.91 
 
 
315 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  35.59 
 
 
334 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 
326 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  35.17 
 
 
330 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  36.02 
 
 
333 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14861  sulfurtransferase  36.51 
 
 
319 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.612505 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  36.13 
 
 
312 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  39.32 
 
 
311 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0654  rhodanese-like  35.68 
 
 
319 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.597958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  35.17 
 
 
334 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  38.7 
 
 
323 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  35.59 
 
 
332 aa  175  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  35.17 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  35.17 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  35.8 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  38.14 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  41.43 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  36.48 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  34.71 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  36.25 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  37.66 
 
 
313 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  35.59 
 
 
337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  36.32 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 
275 aa  172  7.999999999999999e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  35.9 
 
 
326 aa  172  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10921  sulfurtransferase  35.22 
 
 
320 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  35.9 
 
 
326 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0905  rhodanese domain-containing protein  33.79 
 
 
462 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  37.24 
 
 
310 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  34.19 
 
 
326 aa  170  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  38.08 
 
 
257 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  35.15 
 
 
341 aa  168  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  34.03 
 
 
352 aa  168  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  34.45 
 
 
352 aa  168  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  32.98 
 
 
350 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  37.18 
 
 
319 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  34.03 
 
 
326 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  36.82 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  32.57 
 
 
331 aa  166  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  37.39 
 
 
316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  36.29 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  36.4 
 
 
310 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  34.76 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0255  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  39.15 
 
 
623 aa  162  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  36.17 
 
 
312 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  35.98 
 
 
310 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  36.17 
 
 
312 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  34.19 
 
 
326 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  34.63 
 
 
269 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  32.78 
 
 
339 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  35.15 
 
 
312 aa  159  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3365  hypothetical protein  33.45 
 
 
297 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09971  sulfurtransferase  34.41 
 
 
310 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>