268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2261 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  90.91 
 
 
334 aa  636    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  95.15 
 
 
333 aa  659    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  90.91 
 
 
334 aa  635    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  91.82 
 
 
334 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  91.21 
 
 
334 aa  638    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  98.79 
 
 
330 aa  681    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  97.58 
 
 
333 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  687    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  91.21 
 
 
334 aa  638    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  82.52 
 
 
326 aa  580  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  84.01 
 
 
350 aa  579  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  82.55 
 
 
326 aa  564  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  79.64 
 
 
332 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  80.92 
 
 
326 aa  545  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  77.91 
 
 
327 aa  542  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  75.15 
 
 
331 aa  530  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  69.14 
 
 
341 aa  488  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  69.97 
 
 
337 aa  489  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  67.68 
 
 
352 aa  485  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  66.77 
 
 
352 aa  478  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  70.03 
 
 
336 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  72.56 
 
 
332 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  66.97 
 
 
339 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  68.77 
 
 
326 aa  464  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  69.81 
 
 
326 aa  465  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  66.06 
 
 
328 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  66.97 
 
 
326 aa  461  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  65.63 
 
 
323 aa  451  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  67.88 
 
 
309 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  65.58 
 
 
312 aa  431  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  64.71 
 
 
323 aa  433  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  66.55 
 
 
310 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  66.22 
 
 
310 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  65.54 
 
 
310 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  64.86 
 
 
310 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  64.14 
 
 
313 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  64.19 
 
 
317 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  64.86 
 
 
317 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  62.54 
 
 
312 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  62.3 
 
 
314 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  62.54 
 
 
312 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  59.8 
 
 
309 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  59.47 
 
 
309 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  59.93 
 
 
314 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  61.03 
 
 
306 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  60 
 
 
308 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  60 
 
 
305 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  56.52 
 
 
304 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  58.69 
 
 
305 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  56.86 
 
 
302 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  58.72 
 
 
315 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  57.53 
 
 
305 aa  363  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  56.21 
 
 
319 aa  362  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  54.37 
 
 
316 aa  359  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  57.19 
 
 
305 aa  352  4e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  53.72 
 
 
316 aa  352  5e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  53.92 
 
 
322 aa  350  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  56.21 
 
 
294 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  55.03 
 
 
301 aa  349  3e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  55.74 
 
 
317 aa  349  3e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  52.16 
 
 
311 aa  334  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  50.99 
 
 
322 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  54.39 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  48.2 
 
 
555 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  52.9 
 
 
299 aa  324  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  58.47 
 
 
257 aa  311  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10921  sulfurtransferase  47.97 
 
 
320 aa  308  8e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1635  rhodanese-like protein  46.33 
 
 
327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  48.5 
 
 
312 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09971  sulfurtransferase  49.83 
 
 
310 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14861  sulfurtransferase  47.42 
 
 
319 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.612505 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1395  rhodanese-like protein  45.54 
 
 
305 aa  296  3e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  55.04 
 
 
254 aa  296  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0654  rhodanese-like  46.74 
 
 
319 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.597958  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11851  sulfurtransferase  47.68 
 
 
310 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.403922  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  54.62 
 
 
254 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1078  rhodanese-like protein  54.89 
 
 
255 aa  278  6e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0473759  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  53.56 
 
 
255 aa  275  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2196  hypothetical protein  53.59 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12011  sulfurtransferase  44.37 
 
 
310 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.303044  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1105  rhodanese-like protein  44.7 
 
 
310 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  44.85 
 
 
269 aa  258  9e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12001  sulfurtransferase  43.71 
 
 
310 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.982527  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  50.85 
 
 
242 aa  255  8e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  43.66 
 
 
275 aa  246  3e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0206  rhodanese-like protein  44.85 
 
 
274 aa  246  4e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  42.81 
 
 
623 aa  241  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0896  rhodanese domain-containing protein  44.89 
 
 
275 aa  239  4e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.259251  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26565  predicted protein  40.97 
 
 
346 aa  233  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2009  rhodanese superfamily protein  43.96 
 
 
287 aa  221  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  0.757941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2404  rhodanese superfamily protein  43.96 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954244  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  43.48 
 
 
282 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  41.67 
 
 
282 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0255  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  42.09 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1702  rhodanese superfamily protein  39.64 
 
 
334 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2314  rhodanese superfamily protein  39.93 
 
 
284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2337  rhodanese superfamily protein  39.86 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0128371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3293  rhodanese superfamily protein  38.85 
 
 
287 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0983  rhodanese superfamily protein  38.93 
 
 
333 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>