234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3365 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3365  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3153  hypothetical protein  92.93 
 
 
297 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.860693 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29370  predicted sulfurtransferase  63.64 
 
 
303 aa  398  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0616  hypothetical protein  61.77 
 
 
304 aa  387  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2977  Rhodanese domain protein  61.35 
 
 
278 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18110  hypothetical protein  56.9 
 
 
309 aa  354  7.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.022493  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3404  Rhodanese domain protein  59.57 
 
 
281 aa  341  7e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1859  Rhodanese domain protein  40 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52383  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0918  hypothetical protein  36.62 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0883214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0476  hypothetical protein  35.09 
 
 
328 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217138  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1671  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 
321 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3631  hypothetical protein  34.29 
 
 
312 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0916  hypothetical protein  32.99 
 
 
328 aa  168  9e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1464  hypothetical protein  32.76 
 
 
324 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0473945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1989  hypothetical protein  33.45 
 
 
319 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1961  hypothetical protein  33.11 
 
 
319 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.564375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1736  hypothetical protein  32.76 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1875  hypothetical protein  33.11 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1744  hypothetical protein  32.76 
 
 
319 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.216312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1719  hypothetical protein  32.76 
 
 
319 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1694  hypothetical protein  32.76 
 
 
319 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3469  hypothetical protein  33.11 
 
 
319 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000879156  hitchhiker  0.000000000000171941 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1881  hypothetical protein  32.76 
 
 
319 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1916  hypothetical protein  32.76 
 
 
319 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000576752 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  34.89 
 
 
323 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0588  hypothetical protein  33.45 
 
 
327 aa  159  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2691  hypothetical protein  36.54 
 
 
312 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.238447  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2770  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2713  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0311305  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2316  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0905  rhodanese domain-containing protein  32.87 
 
 
462 aa  156  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1324  hypothetical protein  33.21 
 
 
319 aa  155  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1434  hypothetical protein  31.99 
 
 
328 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0127519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  33.58 
 
 
294 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  33.47 
 
 
623 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03470  hypothetical protein  31.65 
 
 
343 aa  149  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.909534  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  33.46 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  32.95 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  33.21 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
346 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  34.24 
 
 
356 aa  145  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  33.72 
 
 
334 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  32.07 
 
 
332 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  34.98 
 
 
255 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  33.72 
 
 
330 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 
327 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 
326 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  33.33 
 
 
333 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  33.22 
 
 
350 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  30.21 
 
 
304 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  33.72 
 
 
333 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  32.74 
 
 
305 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  33.59 
 
 
309 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  33.33 
 
 
330 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  31.13 
 
 
305 aa  142  9e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01051  hypothetical protein  32.86 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2591  Rhodanese domain protein  32.86 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  32.36 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01059  hypothetical protein  32.86 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  32.86 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  32.86 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  32.86 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  31.79 
 
 
312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  33.1 
 
 
350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1078  rhodanese-like protein  34.57 
 
 
255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0473759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2196  hypothetical protein  35.54 
 
 
255 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 
322 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  32.37 
 
 
350 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  34.46 
 
 
339 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0473  rhodanese-related sulfurtransferase  37.19 
 
 
237 aa  139  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2519  hypothetical protein  33.33 
 
 
355 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  30.21 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1668  hypothetical protein  31.94 
 
 
355 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  35.38 
 
 
312 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1560  hypothetical protein  31.94 
 
 
355 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.517054  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1710  hypothetical protein  31.94 
 
 
339 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.351955  hitchhiker  0.000231856 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  32.99 
 
 
314 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1694  putative sulfurtransferase  36.78 
 
 
237 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1223  hypothetical protein  32.63 
 
 
350 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  32.37 
 
 
341 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1267  hypothetical protein  32.28 
 
 
350 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  33.59 
 
 
326 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  31.7 
 
 
309 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  31.79 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2217  hypothetical protein  32.28 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.598434 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2033  hypothetical protein  32.28 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  31.56 
 
 
337 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2824  hypothetical protein  33.1 
 
 
355 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.912445  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  33.05 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
555 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1252  hypothetical protein  32.28 
 
 
350 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.987741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  34.21 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  32.58 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  32.55 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  32.96 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>