More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03470 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03470  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  709    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.909534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0905  rhodanese domain-containing protein  66.96 
 
 
462 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  57.61 
 
 
346 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  56.42 
 
 
356 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2519  hypothetical protein  54.03 
 
 
355 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2824  hypothetical protein  53.73 
 
 
355 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.912445  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1608  Rhodanese domain protein  53.43 
 
 
353 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1569  hypothetical protein  51.34 
 
 
349 aa  368  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.626506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2033  hypothetical protein  51.94 
 
 
350 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1267  hypothetical protein  51.94 
 
 
350 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1560  hypothetical protein  53.43 
 
 
355 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.517054  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1223  hypothetical protein  51.64 
 
 
350 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1668  hypothetical protein  53.43 
 
 
355 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2217  hypothetical protein  51.64 
 
 
350 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.598434 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1252  hypothetical protein  51.34 
 
 
350 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.987741 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1710  hypothetical protein  55.21 
 
 
339 aa  361  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.351955  hitchhiker  0.000231856 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  51.34 
 
 
350 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  51.04 
 
 
350 aa  358  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2591  Rhodanese domain protein  51.04 
 
 
350 aa  358  8e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894148  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01051  hypothetical protein  51.04 
 
 
350 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01059  hypothetical protein  51.04 
 
 
350 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  50.75 
 
 
350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  50.75 
 
 
350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  50.75 
 
 
350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1574  Rhodanese domain protein  50.75 
 
 
352 aa  349  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0454  rhodanese-like domain-containing protein  47.06 
 
 
324 aa  301  1e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.622343  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50174  predicted protein  35.42 
 
 
906 aa  194  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0476  hypothetical protein  39.58 
 
 
328 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217138  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0918  hypothetical protein  39.37 
 
 
318 aa  182  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0883214 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1859  Rhodanese domain protein  36.9 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1671  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 
321 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3631  hypothetical protein  35.54 
 
 
312 aa  176  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0916  hypothetical protein  35.05 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2691  hypothetical protein  36.21 
 
 
312 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.238447  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  34.43 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  34.43 
 
 
330 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1916  hypothetical protein  33.57 
 
 
319 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000576752 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1744  hypothetical protein  33.57 
 
 
319 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.216312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1719  hypothetical protein  33.57 
 
 
319 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1694  hypothetical protein  33.57 
 
 
319 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2770  hypothetical protein  36.36 
 
 
318 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1989  hypothetical protein  33.22 
 
 
319 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1881  hypothetical protein  33.57 
 
 
319 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2713  hypothetical protein  36.36 
 
 
318 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0311305  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1875  hypothetical protein  33.22 
 
 
319 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  39.66 
 
 
254 aa  159  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1961  hypothetical protein  33.22 
 
 
319 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.564375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  33.7 
 
 
330 aa  159  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  37.89 
 
 
333 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3469  hypothetical protein  32.52 
 
 
319 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000879156  hitchhiker  0.000000000000171941 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0588  hypothetical protein  32.65 
 
 
327 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2316  hypothetical protein  34.72 
 
 
320 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  37.44 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1736  hypothetical protein  33.22 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  38.33 
 
 
341 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  37 
 
 
334 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  33.7 
 
 
334 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  37 
 
 
334 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  33.7 
 
 
334 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  39.24 
 
 
254 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  36.61 
 
 
269 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  36.64 
 
 
257 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  36.68 
 
 
326 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  35.78 
 
 
304 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1324  hypothetical protein  31.63 
 
 
319 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1434  hypothetical protein  32.65 
 
 
328 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0127519  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  35.34 
 
 
302 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09971  sulfurtransferase  33.82 
 
 
310 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1635  rhodanese-like protein  37.39 
 
 
327 aa  149  6e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1464  hypothetical protein  31.47 
 
 
324 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0473945  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3365  hypothetical protein  31.65 
 
 
297 aa  149  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  33.7 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  36.12 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0616  hypothetical protein  30.43 
 
 
304 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  33.88 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  30.17 
 
 
352 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  35.22 
 
 
339 aa  146  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
332 aa  146  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 
327 aa  146  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1395  rhodanese-like protein  34.75 
 
 
305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  29.83 
 
 
352 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18110  hypothetical protein  31.32 
 
 
309 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.022493  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  34.82 
 
 
331 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  36.64 
 
 
323 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  36.91 
 
 
326 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
311 aa  142  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 
309 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 
326 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  29.41 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  34.92 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3153  hypothetical protein  30.64 
 
 
297 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.860693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  32.11 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  30.25 
 
 
317 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  29.96 
 
 
301 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  32.06 
 
 
323 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  35.18 
 
 
309 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  37.02 
 
 
326 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29370  predicted sulfurtransferase  28.85 
 
 
303 aa  139  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  30.8 
 
 
319 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  32.93 
 
 
328 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>