224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0616 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0616  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  630  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29370  predicted sulfurtransferase  65.07 
 
 		 303 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3365  hypothetical protein  61.77 
 
 		 297 aa  387  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3153  hypothetical protein  61.86 
 
 		 297 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.860693 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18110  hypothetical protein  55.25 
 
 		 309 aa  341  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.022493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2977  Rhodanese domain protein  54.71 
 
 		 278 aa  326  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3404  Rhodanese domain protein  53.74 
 
 		 281 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1859  Rhodanese domain protein  39.15 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1671  Rhodanese domain protein  36.61 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0476  hypothetical protein  34.16 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0916  hypothetical protein  31.88 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2770  hypothetical protein  32.54 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2713  hypothetical protein  32.54 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0311305  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2316  hypothetical protein  30.26 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2691  hypothetical protein  33.79 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.238447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0905  rhodanese domain-containing protein  32.53 
 
 		 462 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1961  hypothetical protein  31.36 
 
 		 319 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.564375  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0918  hypothetical protein  32.42 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0883214 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1989  hypothetical protein  31.38 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3631  hypothetical protein  30.87 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0588  hypothetical protein  34.51 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1744  hypothetical protein  31.01 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.216312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1719  hypothetical protein  31.01 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1694  hypothetical protein  31.01 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1881  hypothetical protein  31.01 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1916  hypothetical protein  31.01 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000576752 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1324  hypothetical protein  30.13 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1464  hypothetical protein  30.74 
 
 		 324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0473945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3469  hypothetical protein  31.03 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000879156  hitchhiker  0.000000000000171941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1875  hypothetical protein  31.03 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1736  hypothetical protein  30.85 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  34.39 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03470  hypothetical protein  30.43 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.909534  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  33.99 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  33.86 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  32.81 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1434  hypothetical protein  29.79 
 
 		 328 aa  142  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0127519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  32.77 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  31.52 
 
 		 623 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  35.62 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  32.81 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  32.54 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  32.54 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  34 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  33.99 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  31.65 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  31.13 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  34.36 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  33.99 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  31.2 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  33.47 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  34.76 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1608  Rhodanese domain protein  32.66 
 
 		 353 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  33.69 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  28.85 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  31.13 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2824  hypothetical protein  31.49 
 
 		 355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.912445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01051  hypothetical protein  33.69 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2591  Rhodanese domain protein  33.69 
 
 		 350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894148  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01059  hypothetical protein  33.69 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0255  rhodanese domain-containing protein  31.94 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  30.31 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  33.69 
 
 		 350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  32.81 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  33.2 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  33.46 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2519  hypothetical protein  30.74 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  30.79 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  32.41 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  32.81 
 
 		 310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  32.77 
 
 		 322 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  34.76 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  33.91 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  32.02 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  33.69 
 
 		 350 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  32.81 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1560  hypothetical protein  31.58 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.517054  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1668  hypothetical protein  31.58 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1710  hypothetical protein  31.58 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.351955  hitchhiker  0.000231856 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1078  rhodanese-like protein  34.73 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0473759  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  28.46 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  32.8 
 
 		 306 aa  129  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2196  hypothetical protein  33.47 
 
 		 255 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  31.2 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  31.6 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  33.81 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  31.64 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  31.1 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  33.81 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  31.6 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  32.41 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  31.6 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  31.6 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  31.6 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10921  sulfurtransferase  31.25 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  32.17 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  32.42 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1223  hypothetical protein  31.77 
 
 		 350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  30.2 
 
 		 316 aa  126  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>