213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2937 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  100 
 
 
316 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  83.97 
 
 
316 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  69.94 
 
 
319 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  59.48 
 
 
309 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  57.93 
 
 
309 aa  381  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  56.63 
 
 
323 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  57.52 
 
 
309 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  54.75 
 
 
336 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  54.9 
 
 
314 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  60.9 
 
 
555 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  54.37 
 
 
328 aa  363  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  55.74 
 
 
312 aa  362  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  58.55 
 
 
317 aa  362  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  54.69 
 
 
326 aa  362  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  54.05 
 
 
326 aa  362  4e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  57 
 
 
315 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  55.02 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  54.05 
 
 
334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  58.18 
 
 
311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  54.37 
 
 
331 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  54.05 
 
 
334 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  54.69 
 
 
334 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  55.05 
 
 
312 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  54.05 
 
 
334 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  57.72 
 
 
305 aa  355  5.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  55.63 
 
 
341 aa  354  8.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  54.37 
 
 
333 aa  354  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  53.64 
 
 
323 aa  354  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  54.05 
 
 
334 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  52.75 
 
 
326 aa  354  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  54.61 
 
 
317 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  54.05 
 
 
332 aa  353  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  53.25 
 
 
326 aa  353  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  53.72 
 
 
330 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  54.72 
 
 
312 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  53.72 
 
 
330 aa  352  5e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  55.56 
 
 
314 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  53.4 
 
 
333 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  54.07 
 
 
339 aa  349  4e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  53.62 
 
 
313 aa  348  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  54.05 
 
 
326 aa  348  5e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  53.95 
 
 
317 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  53.27 
 
 
352 aa  348  1e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  52.94 
 
 
352 aa  347  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  54.7 
 
 
306 aa  345  5e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  54.3 
 
 
350 aa  345  5e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  55.59 
 
 
322 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  52.96 
 
 
310 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  52.09 
 
 
337 aa  343  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  52.63 
 
 
310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  52.96 
 
 
310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  52.75 
 
 
327 aa  342  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  52.96 
 
 
310 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  55.52 
 
 
302 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  55.37 
 
 
305 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  53.07 
 
 
326 aa  340  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  55.37 
 
 
308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  54.85 
 
 
304 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  53.16 
 
 
305 aa  338  9e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  54.29 
 
 
322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  54.07 
 
 
305 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  53.54 
 
 
294 aa  332  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  56.33 
 
 
299 aa  328  7e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  55.05 
 
 
313 aa  324  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  54.58 
 
 
312 aa  319  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  52.29 
 
 
301 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  55.17 
 
 
257 aa  298  9e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1635  rhodanese-like protein  46.39 
 
 
327 aa  276  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09971  sulfurtransferase  45.12 
 
 
310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0654  rhodanese-like  41.64 
 
 
319 aa  272  7e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.597958  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1395  rhodanese-like protein  45.28 
 
 
305 aa  271  7e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14861  sulfurtransferase  41.64 
 
 
319 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.612505 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10921  sulfurtransferase  42 
 
 
320 aa  269  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  57.32 
 
 
242 aa  265  7e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2196  hypothetical protein  51.16 
 
 
255 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  50.62 
 
 
255 aa  262  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  45.9 
 
 
254 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1078  rhodanese-like protein  52.26 
 
 
255 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0473759  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  46.31 
 
 
254 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  44.73 
 
 
275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11851  sulfurtransferase  38.82 
 
 
310 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.403922  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0206  rhodanese-like protein  38.55 
 
 
274 aa  235  7e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1105  rhodanese-like protein  37.46 
 
 
310 aa  235  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12001  sulfurtransferase  36.45 
 
 
310 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.982527  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12011  sulfurtransferase  36.79 
 
 
310 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.303044  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  44.22 
 
 
269 aa  229  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0896  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 
275 aa  225  6e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.259251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  40.13 
 
 
623 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26565  predicted protein  41.19 
 
 
346 aa  222  6e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460392  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0255  rhodanese domain-containing protein  40.35 
 
 
302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  38.54 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  39.36 
 
 
282 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2009  rhodanese superfamily protein  38.33 
 
 
287 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  0.757941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0981  rhodanese domain-containing protein  44.98 
 
 
247 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2404  rhodanese superfamily protein  37.98 
 
 
287 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954244  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3293  rhodanese superfamily protein  38.57 
 
 
287 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1252  rhodanese superfamily protein  38.57 
 
 
287 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654472  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1702  rhodanese superfamily protein  39.51 
 
 
334 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2314  rhodanese superfamily protein  40.21 
 
 
284 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2080  rhodanese superfamily protein  37.98 
 
 
327 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0163849  normal  0.0671695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>