263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3404 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3404  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 281 aa  569  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2977  Rhodanese domain protein  72.26 
 
 		 278 aa  411  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3365  hypothetical protein  59.57 
 
 		 297 aa  358  7e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3153  hypothetical protein  62.32 
 
 		 297 aa  357  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.860693 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29370  predicted sulfurtransferase  60.22 
 
 		 303 aa  347  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18110  hypothetical protein  58.57 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.022493  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0616  hypothetical protein  53.74 
 
 		 304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1859  Rhodanese domain protein  39.46 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3631  hypothetical protein  35.13 
 
 		 312 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 		 294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0476  hypothetical protein  35.13 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217138  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1744  hypothetical protein  33.71 
 
 		 319 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.216312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1719  hypothetical protein  33.71 
 
 		 319 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1694  hypothetical protein  33.71 
 
 		 319 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3469  hypothetical protein  33.71 
 
 		 319 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000879156  hitchhiker  0.000000000000171941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1671  Rhodanese domain protein  34.41 
 
 		 321 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1881  hypothetical protein  33.71 
 
 		 319 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1989  hypothetical protein  33.71 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1916  hypothetical protein  33.71 
 
 		 319 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000576752 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1961  hypothetical protein  33.71 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.564375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1875  hypothetical protein  33.71 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1464  hypothetical protein  33.61 
 
 		 324 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0473945  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0918  hypothetical protein  34.18 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0883214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2691  hypothetical protein  35.48 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.238447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1736  hypothetical protein  33.71 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0916  hypothetical protein  32.97 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  34.52 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  32.85 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0905  rhodanese domain-containing protein  32.25 
 
 		 462 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0588  hypothetical protein  36.07 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  31.29 
 
 		 305 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  34.98 
 
 		 306 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1324  hypothetical protein  34.43 
 
 		 319 aa  149  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  31.29 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  33.21 
 
 		 333 aa  148  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2770  hypothetical protein  35.25 
 
 		 318 aa  148  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2713  hypothetical protein  35.25 
 
 		 318 aa  148  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0311305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 		 315 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  35.25 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  32.55 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 		 326 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1434  hypothetical protein  36.44 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0127519  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  34.47 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  32.97 
 
 		 326 aa  145  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  32.49 
 
 		 305 aa  145  9e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  34.47 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 332 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  31.43 
 
 		 623 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  32.5 
 
 		 334 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  32.5 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  33.69 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  34.29 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  34.77 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  32.5 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  33.21 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  32.36 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  34.64 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  32.01 
 
 		 314 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  32.26 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  32.5 
 
 		 334 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2316  hypothetical protein  33.46 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  33.81 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  32.5 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  35.59 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  32.5 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  32.5 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  31.9 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  31.9 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  33.45 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  31.67 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03470  hypothetical protein  31.21 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.909534  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  31.39 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  32.36 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  33.09 
 
 		 352 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  33.45 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  32.73 
 
 		 352 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  31.79 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  34.64 
 
 		 314 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  32.42 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  34.84 
 
 		 555 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  32.05 
 
 		 327 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  33.7 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  33.09 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2196  hypothetical protein  35.95 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  31.56 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  31.56 
 
 		 326 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  32.38 
 
 		 336 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  35.27 
 
 		 255 aa  135  9e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  33.21 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  32.64 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  31.65 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  32.14 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  30.14 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  30.71 
 
 		 332 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  32.73 
 
 		 311 aa  132  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0239386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>