More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2691 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2691  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  644    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.238447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0476  hypothetical protein  65.36 
 
 		 328 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0918  hypothetical protein  62.06 
 
 		 318 aa  423  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0883214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3631  hypothetical protein  61.92 
 
 		 312 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1671  Rhodanese domain protein  61.11 
 
 		 321 aa  394  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1859  Rhodanese domain protein  46.74 
 
 		 314 aa  267  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2770  hypothetical protein  47.08 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2713  hypothetical protein  47.08 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0311305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1961  hypothetical protein  46.23 
 
 		 319 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.564375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1989  hypothetical protein  46.23 
 
 		 319 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3469  hypothetical protein  46.23 
 
 		 319 aa  263  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000879156  hitchhiker  0.000000000000171941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1875  hypothetical protein  46.23 
 
 		 319 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1744  hypothetical protein  45.89 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.216312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1719  hypothetical protein  45.89 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1694  hypothetical protein  45.89 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1464  hypothetical protein  45.21 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0473945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1881  hypothetical protein  45.89 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1916  hypothetical protein  45.89 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000576752 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2316  hypothetical protein  45.02 
 
 		 320 aa  259  6e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1736  hypothetical protein  45.21 
 
 		 319 aa  258  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0588  hypothetical protein  43.1 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1434  hypothetical protein  42.16 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0127519  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1324  hypothetical protein  42.47 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0916  hypothetical protein  37.04 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  39.92 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  40.74 
 
 		 337 aa  189  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  40.33 
 
 		 254 aa  189  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  39.09 
 
 		 352 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  39.92 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  42.59 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  41.2 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03470  hypothetical protein  36.21 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.909534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0905  rhodanese domain-containing protein  37.68 
 
 		 462 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0616  hypothetical protein  34.13 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  38 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  37.3 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29370  predicted sulfurtransferase  32.37 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  36.49 
 
 		 350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01051  hypothetical protein  36.75 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2591  Rhodanese domain protein  36.49 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894148  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01059  hypothetical protein  36.75 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  36.49 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  36.8 
 
 		 257 aa  172  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  38.36 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  37.2 
 
 		 623 aa  170  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  39.91 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  39.04 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18110  hypothetical protein  35.36 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.022493  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  37.33 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  36.21 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2519  hypothetical protein  33.8 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  41.26 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  35.79 
 
 		 350 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3365  hypothetical protein  36.88 
 
 		 297 aa  170  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1569  hypothetical protein  35.66 
 
 		 349 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.626506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  35.79 
 
 		 350 aa  169  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  35.79 
 
 		 350 aa  169  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  36.69 
 
 		 326 aa  168  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  40.91 
 
 		 334 aa  168  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  41.92 
 
 		 334 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  36.44 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  41.92 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  35.51 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  41.92 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  41.54 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  36.91 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  34.84 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  41.92 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3153  hypothetical protein  37.72 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.860693 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  36.48 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  36.61 
 
 		 326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  38.22 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  36.05 
 
 		 330 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  38.77 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  40.27 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  36.48 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  37.33 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2824  hypothetical protein  33.33 
 
 		 355 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.912445  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  35.51 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  35.51 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3404  Rhodanese domain protein  36.2 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  39.11 
 
 		 310 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  38.26 
 
 		 312 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10921  sulfurtransferase  33.07 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  39.04 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  37.78 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0255  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  39.81 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0473  rhodanese-related sulfurtransferase  39.6 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  34.15 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  34.8 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  38.33 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  39.11 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  33.74 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  37.83 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  37.78 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  37.28 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>