More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1287 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  100 
 
 
159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  37.82 
 
 
123 aa  88.6  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  37.82 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  34.45 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.71 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  33.61 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  33.91 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  37.5 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 
438 aa  77.8  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  36.52 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  35.59 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  39.25 
 
 
113 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  35.77 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  36.52 
 
 
361 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  32 
 
 
120 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  32.77 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  32.23 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 
123 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.96 
 
 
388 aa  68.9  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  32.52 
 
 
323 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  29.75 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  35.85 
 
 
346 aa  68.6  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  33.87 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  32.31 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.91 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  34.13 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.93 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  34.75 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  28.91 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  33.03 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.16 
 
 
393 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.11 
 
 
480 aa  64.7  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  29.66 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  27.69 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  33.94 
 
 
186 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  35.78 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  34.19 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  35.78 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.51 
 
 
395 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  29.01 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.58 
 
 
375 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  29.36 
 
 
133 aa  62.4  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  35.78 
 
 
186 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  35.78 
 
 
186 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  35.78 
 
 
186 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  30.4 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  32.8 
 
 
131 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 
269 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  29.6 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  29.6 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 
186 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  29.6 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 
128 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  31.67 
 
 
128 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  29.6 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.09 
 
 
478 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
478 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  30.61 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  30.61 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  28.46 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.28 
 
 
392 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  30.4 
 
 
132 aa  58.9  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.04 
 
 
392 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  31.19 
 
 
194 aa  58.2  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  58.2  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 
129 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  33.33 
 
 
146 aa  58.2  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  29.17 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  33.96 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  29.66 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 
150 aa  57.8  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  30.34 
 
 
119 aa  57.4  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  30.17 
 
 
114 aa  57.4  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  28.26 
 
 
119 aa  57.4  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  28.97 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 
103 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.83 
 
 
478 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.89 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  32.22 
 
 
119 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.21 
 
 
390 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  28.26 
 
 
119 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  28.26 
 
 
119 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 
220 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  30 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.17 
 
 
398 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  29.46 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  30.36 
 
 
354 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  30.4 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  27.13 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  28.33 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  33.04 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>