71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1819 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1819  Rhodanese domain protein  100 
 
 
271 aa  568  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0546  Rhodanese domain protein  38.72 
 
 
278 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.306524  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2261  sulfurtransferase  35.5 
 
 
271 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  30.81 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  37.14 
 
 
380 aa  63.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  27.38 
 
 
252 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  37.78 
 
 
169 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  25.67 
 
 
247 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  27.55 
 
 
363 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  37.21 
 
 
172 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 
147 aa  52.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  32.46 
 
 
142 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
164 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.73 
 
 
387 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 
164 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  33 
 
 
226 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  31.82 
 
 
170 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 
167 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  28.95 
 
 
454 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  29.05 
 
 
432 aa  48.9  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  29.13 
 
 
390 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  34.88 
 
 
423 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.13 
 
 
390 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  32.08 
 
 
184 aa  47.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
142 aa  46.6  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  25.81 
 
 
128 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.16 
 
 
390 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  36.9 
 
 
356 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  30.43 
 
 
252 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
234 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0273  rhodanese domain-containing protein  28.21 
 
 
136 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  36.21 
 
 
117 aa  45.4  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  29.01 
 
 
145 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  39.06 
 
 
98 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  25.2 
 
 
135 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  27.91 
 
 
222 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0342  rhodanese domain-containing protein  28.23 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  32.32 
 
 
102 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  30.95 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
226 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1608  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 
353 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  29.33 
 
 
109 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  34.06 
 
 
129 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  35.8 
 
 
133 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  28.71 
 
 
126 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  35.8 
 
 
132 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  32 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  28.43 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  35.8 
 
 
132 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
231 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
221 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 
189 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
102 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  25.47 
 
 
197 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  28 
 
 
198 aa  42.7  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
102 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
218 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
227 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  31.13 
 
 
140 aa  42.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  34.15 
 
 
133 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
226 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1668  hypothetical protein  32.53 
 
 
355 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1560  hypothetical protein  32.53 
 
 
355 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.517054  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05030  hypothetical protein  26.67 
 
 
163 aa  42.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2519  hypothetical protein  31.76 
 
 
355 aa  42.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  28.8 
 
 
177 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1710  hypothetical protein  32.14 
 
 
339 aa  42.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.351955  hitchhiker  0.000231856 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 
138 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>