17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0546 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0546  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 278 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.306524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1819  Rhodanese domain protein  39.04 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2261  sulfurtransferase  32.72 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  29.79 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  29.58 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  37.35 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  29 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  25.97 
 
 		 252 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 		 432 aa  45.8  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 144 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  27.18 
 
 		 380 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  31.71 
 
 		 144 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 353 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  37.93 
 
 		 130 aa  43.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  30.95 
 
 		 138 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  26.67 
 
 		 363 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>