81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2261 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2261  sulfurtransferase  100 
 
 		 271 aa  559  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1819  Rhodanese domain protein  36.89 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0546  Rhodanese domain protein  32.72 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.306524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  26.6 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  23.38 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  26.32 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 142 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 		 147 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  30.25 
 
 		 401 aa  52  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  32.22 
 
 		 141 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  29.63 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.94 
 
 		 142 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  30.34 
 
 		 363 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2662  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 120 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.553385  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 		 432 aa  49.3  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 380 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  36.26 
 
 		 123 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  21.43 
 
 		 162 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  31.76 
 
 		 647 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 226 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  27.36 
 
 		 123 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 		 167 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  29.41 
 
 		 172 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  31.03 
 
 		 170 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1098  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 128 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.50034  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  24.81 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  26.21 
 
 		 169 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  31.13 
 
 		 140 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 		 480 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1901  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 		 159 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 151 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  35.16 
 
 		 123 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0588  hypothetical protein  32.14 
 
 		 327 aa  46.2  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1464  hypothetical protein  29.53 
 
 		 324 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0473945  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1434  hypothetical protein  30.95 
 
 		 328 aa  45.8  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0127519  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2316  hypothetical protein  34.52 
 
 		 320 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  25.95 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  29 
 
 		 113 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2794  rhodanese domain-containing protein  25.17 
 
 		 147 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.718794  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0454  rhodanese-like domain-containing protein  30 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.622343  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  34.48 
 
 		 124 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  34.48 
 
 		 124 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  27.55 
 
 		 129 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  28.12 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  23.53 
 
 		 170 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  26 
 
 		 153 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  27.08 
 
 		 144 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  29.67 
 
 		 144 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 114 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  26.73 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  27.59 
 
 		 164 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  26.92 
 
 		 179 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.57 
 
 		 393 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 221 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  32.05 
 
 		 125 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1592  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 128 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0744252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  26.79 
 
 		 157 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1625  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 128 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.535046  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 226 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  27.55 
 
 		 129 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47291  predicted protein  29.6 
 
 		 475 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 		 126 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  26.71 
 
 		 144 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 124 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  30.77 
 
 		 177 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  27.19 
 
 		 323 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2346  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.71 
 
 		 549 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.705893  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.81 
 
 		 390 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  25.53 
 
 		 144 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  30.12 
 
 		 533 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  26.4 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  25 
 
 		 126 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 535 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 145 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  34.52 
 
 		 184 aa  42.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 221 aa  42.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  28.46 
 
 		 171 aa  42  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  30.49 
 
 		 528 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>