150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1524 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
162 aa  329  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  31.16 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3711  rhodanese domain-containing protein  32.84 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0309402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0273  rhodanese domain-containing protein  30.5 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  33.88 
 
 
406 aa  63.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  28.79 
 
 
380 aa  63.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1929  rhodanese-like protein  31.34 
 
 
188 aa  60.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.6245300000000003e-19  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1543  rhodanese domain-containing protein  31.65 
 
 
216 aa  60.8  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  25.62 
 
 
112 aa  57.4  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  46 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  27.87 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  28.91 
 
 
423 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  26.81 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  26.98 
 
 
218 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  26.89 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3184  rhodanese  27.14 
 
 
200 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1650  rhodanese-like protein  28.03 
 
 
217 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000948932  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
227 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  25.16 
 
 
252 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  26.81 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
231 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
221 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4882  rhodanese domain-containing protein  26.32 
 
 
191 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.70517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2268  rhodanese domain-containing protein  26.32 
 
 
191 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0627925  normal  0.0852757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  27.5 
 
 
247 aa  50.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1028  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 
237 aa  50.8  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186983  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  28.8 
 
 
401 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 
265 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  29.77 
 
 
388 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  29.17 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
258 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  25.36 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  28.23 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  27.45 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
222 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  29.51 
 
 
353 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  25.61 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  26.89 
 
 
223 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2096  Rhodanese domain protein  28.46 
 
 
258 aa  48.5  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  25.66 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2261  sulfurtransferase  21.43 
 
 
271 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
233 aa  48.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  25.18 
 
 
164 aa  48.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  30.84 
 
 
305 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  25 
 
 
221 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  27.43 
 
 
131 aa  47.8  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1145  Rhodanese domain protein  27.05 
 
 
262 aa  47.8  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709325  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  26.89 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  28.43 
 
 
454 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  28.1 
 
 
144 aa  47.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.4 
 
 
805 aa  47.4  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 
480 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  25.58 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1668  rhodanese-like protein  25.45 
 
 
218 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  30.3 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  29.24 
 
 
647 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  27.45 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  25.58 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  25.49 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
219 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  24.84 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  25.6 
 
 
480 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  23.68 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
224 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  26.61 
 
 
126 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
224 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
224 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
224 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
230 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  25.18 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
224 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  23.96 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  27.08 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  29.69 
 
 
221 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  28.16 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  28.1 
 
 
171 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  28.16 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 
174 aa  44.7  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  27.68 
 
 
189 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  23.53 
 
 
172 aa  44.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  23.53 
 
 
226 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  27.52 
 
 
161 aa  43.9  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
124 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  23.97 
 
 
300 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  24.84 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  28.45 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  28.8 
 
 
273 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  21.85 
 
 
218 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  26.98 
 
 
124 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  25.66 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  24.06 
 
 
226 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  22.88 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  25 
 
 
290 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  24.84 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  28.8 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  29.03 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  24.16 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1774  rhodanese  25.33 
 
 
195 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  23.58 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>