More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0511 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
647 aa  1301    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  35.1 
 
 
419 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  34.77 
 
 
283 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  34.16 
 
 
281 aa  137  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  29.39 
 
 
321 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  29.39 
 
 
321 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.32 
 
 
218 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  33.93 
 
 
281 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  43.32 
 
 
218 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  42.78 
 
 
218 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  34.26 
 
 
293 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  34.26 
 
 
293 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 
280 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  33.1 
 
 
286 aa  124  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  31.05 
 
 
288 aa  124  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  31.41 
 
 
320 aa  123  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  31.07 
 
 
286 aa  122  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  29.89 
 
 
285 aa  120  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  32.13 
 
 
277 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  30.98 
 
 
296 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  31.65 
 
 
291 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  28.72 
 
 
327 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  26.33 
 
 
290 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  29.15 
 
 
270 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 
321 aa  114  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  33.22 
 
 
301 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  33.45 
 
 
289 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  37.56 
 
 
399 aa  114  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  32.51 
 
 
306 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  43.43 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  28.21 
 
 
321 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  32.27 
 
 
282 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  30.96 
 
 
285 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 
366 aa  110  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 
291 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  42.78 
 
 
237 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 
355 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 
297 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  30.96 
 
 
286 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  31.62 
 
 
293 aa  106  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  32.73 
 
 
340 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  27.41 
 
 
294 aa  106  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  31.96 
 
 
295 aa  106  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  31.05 
 
 
279 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 
271 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0346  rhodanese domain-containing protein  32.75 
 
 
333 aa  106  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  30.96 
 
 
285 aa  105  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  30.28 
 
 
297 aa  105  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
297 aa  105  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  28.27 
 
 
288 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  30.6 
 
 
273 aa  104  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  30.04 
 
 
273 aa  105  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  30 
 
 
271 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  31.69 
 
 
275 aa  104  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  31.67 
 
 
272 aa  104  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  29.82 
 
 
304 aa  103  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  32.76 
 
 
290 aa  103  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  31.77 
 
 
308 aa  103  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  32.16 
 
 
305 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  28.99 
 
 
277 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  29.74 
 
 
271 aa  103  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  28.26 
 
 
281 aa  102  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  28.73 
 
 
277 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  28.73 
 
 
277 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.03 
 
 
291 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.77 
 
 
281 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  31.47 
 
 
281 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  28.73 
 
 
277 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  31.23 
 
 
279 aa  102  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 
312 aa  102  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0560  Rhodanese domain protein  30.58 
 
 
329 aa  101  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000058867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  29.26 
 
 
271 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  31.62 
 
 
282 aa  101  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  29.71 
 
 
277 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  31.29 
 
 
277 aa  100  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  29.48 
 
 
258 aa  100  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  32.51 
 
 
304 aa  100  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  32.27 
 
 
289 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  32.27 
 
 
289 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.05 
 
 
175 aa  100  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  32.27 
 
 
289 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.27 
 
 
289 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.47 
 
 
285 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0501  rhodanese domain-containing protein  30.6 
 
 
285 aa  99.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  32.27 
 
 
289 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.27 
 
 
289 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  32.27 
 
 
289 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  31.23 
 
 
278 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.47 
 
 
285 aa  99.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  29.43 
 
 
281 aa  99.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  30.28 
 
 
305 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  26.52 
 
 
284 aa  98.6  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 
291 aa  98.2  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  28.52 
 
 
286 aa  97.8  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  28.42 
 
 
281 aa  97.8  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  28.98 
 
 
297 aa  97.4  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  28.27 
 
 
297 aa  97.8  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  28.88 
 
 
282 aa  97.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.88 
 
 
282 aa  97.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.57 
 
 
285 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>