More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0346 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0346  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
333 aa  658    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5900  rhodanese domain-containing protein  39.74 
 
 
303 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688028  normal  0.469982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0500  rhodanese domain-containing protein  43.79 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.346469  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3785  rhodanese-like protein  41.22 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  37.01 
 
 
319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0562  Rhodanese domain protein  37.4 
 
 
331 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1650  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
317 aa  149  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  0.100041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2054  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0105049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2561  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.918662  normal  0.131407 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0560  Rhodanese domain protein  34.01 
 
 
329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000058867  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  35.68 
 
 
288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1396  rhodanese domain-containing protein  36.3 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260045  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  33.21 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2738  rhodanese-related sulfurtransferase  36.26 
 
 
315 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.848314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.33 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  31.23 
 
 
283 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  33.67 
 
 
286 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  32.17 
 
 
284 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.46 
 
 
289 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.22 
 
 
285 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.02 
 
 
285 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.68 
 
 
286 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.38 
 
 
279 aa  122  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  34.26 
 
 
282 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.26 
 
 
282 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.36 
 
 
285 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1774  rhodanese domain-containing protein  36.82 
 
 
315 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.608218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  33.8 
 
 
289 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  31.38 
 
 
283 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  30.74 
 
 
295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  33.22 
 
 
284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.68 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  32.75 
 
 
289 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  31.82 
 
 
284 aa  119  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  34.59 
 
 
290 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 
293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  31.29 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  32.13 
 
 
281 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  33.57 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  31.33 
 
 
279 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  30.18 
 
 
277 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  30.18 
 
 
277 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  29.58 
 
 
320 aa  116  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  30.9 
 
 
286 aa  116  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  30.38 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  30.34 
 
 
321 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  38.11 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  31.69 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.21 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  31.85 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  28.91 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.21 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  32.31 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  33.22 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  30.03 
 
 
277 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  30.03 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 
284 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  34.6 
 
 
278 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 
283 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  30.43 
 
 
279 aa  113  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  30.07 
 
 
277 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  30.6 
 
 
277 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  35.31 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.99 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  30.28 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  30.28 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  30.28 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  28.91 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  26.86 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  33.22 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  33.8 
 
 
282 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  27.87 
 
 
290 aa  110  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  30.13 
 
 
301 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  30.1 
 
 
279 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  33.21 
 
 
291 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  34.41 
 
 
284 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 
282 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 
281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  30.99 
 
 
355 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
288 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  29.33 
 
 
282 aa  109  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.45 
 
 
283 aa  109  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.78 
 
 
291 aa  109  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  30.33 
 
 
279 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  32.78 
 
 
647 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  36.24 
 
 
285 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  29.39 
 
 
289 aa  109  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  31.08 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  29.45 
 
 
291 aa  109  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.94 
 
 
285 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  28.03 
 
 
273 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  26.17 
 
 
321 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.04 
 
 
284 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  31.74 
 
 
277 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.68 
 
 
292 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  26.17 
 
 
321 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  32.44 
 
 
301 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  31.05 
 
 
279 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.04 
 
 
284 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>