More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1409 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 
285 aa  584  1e-166  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  74.37 
 
 
282 aa  456  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  68.77 
 
 
293 aa  433  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  69.31 
 
 
295 aa  428  1e-119  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  67.61 
 
 
289 aa  416  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  56.23 
 
 
283 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  53.87 
 
 
285 aa  308  6.999999999999999e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  54.09 
 
 
281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  51.96 
 
 
281 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  53.74 
 
 
281 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  53.68 
 
 
289 aa  299  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  53.17 
 
 
293 aa  295  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  53.17 
 
 
293 aa  295  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  51.96 
 
 
288 aa  291  6e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 
286 aa  289  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  51.96 
 
 
280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  51.42 
 
 
279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  48.58 
 
 
279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  47.33 
 
 
277 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  46.62 
 
 
277 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  46.62 
 
 
277 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  46.62 
 
 
277 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  47.87 
 
 
282 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  46.45 
 
 
277 aa  262  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  48.59 
 
 
287 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  46.79 
 
 
275 aa  259  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  48.75 
 
 
279 aa  259  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  47.52 
 
 
281 aa  258  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  47.37 
 
 
296 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  47.18 
 
 
283 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  47 
 
 
301 aa  256  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  46.62 
 
 
277 aa  256  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  46.62 
 
 
277 aa  256  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  46.29 
 
 
282 aa  255  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  48.4 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  46.62 
 
 
277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  47.5 
 
 
286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  45.58 
 
 
279 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  44.79 
 
 
291 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  46.62 
 
 
275 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  45.61 
 
 
304 aa  249  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  45.91 
 
 
281 aa  248  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  46.26 
 
 
279 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  45.96 
 
 
301 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  46.81 
 
 
279 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  44.41 
 
 
297 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  47.2 
 
 
297 aa  244  9e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  46.4 
 
 
355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  47.87 
 
 
277 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  45.3 
 
 
297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  46.4 
 
 
340 aa  242  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  48.06 
 
 
277 aa  240  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  43.86 
 
 
297 aa  238  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  44.95 
 
 
285 aa  237  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  44.56 
 
 
298 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  44.56 
 
 
298 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  44.56 
 
 
298 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  44.41 
 
 
306 aa  236  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  44.06 
 
 
297 aa  235  8e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  43.51 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  43.86 
 
 
305 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  44.4 
 
 
267 aa  232  6e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  42.11 
 
 
297 aa  232  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  44.86 
 
 
304 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  44.57 
 
 
308 aa  228  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  44.96 
 
 
321 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  41.44 
 
 
305 aa  225  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  42.51 
 
 
297 aa  219  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  41.72 
 
 
307 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  39.43 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  42.81 
 
 
303 aa  212  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  41.36 
 
 
290 aa  209  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  40.54 
 
 
296 aa  208  7e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  38.62 
 
 
366 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  38.52 
 
 
277 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  37.46 
 
 
282 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  34.86 
 
 
283 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  35.32 
 
 
270 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  33.45 
 
 
321 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  33.45 
 
 
321 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  32.42 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  31.54 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  30.04 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0501  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 
285 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  31.49 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.53 
 
 
285 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.87 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  32.85 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  32.51 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.62 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
281 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.14 
 
 
283 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.16 
 
 
286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  30.99 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  30.8 
 
 
321 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  30.93 
 
 
282 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  30.38 
 
 
327 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  28.62 
 
 
290 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.38 
 
 
285 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.41 
 
 
285 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>