More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0560 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0560  Rhodanese domain protein  100 
 
 
329 aa  674    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000058867  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0792  rhodanese domain-containing protein  42.09 
 
 
325 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0198  Rhodanese domain protein  33.02 
 
 
337 aa  179  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0500  rhodanese domain-containing protein  33.44 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.346469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0346  rhodanese domain-containing protein  34.03 
 
 
333 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1647  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
343 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.368982  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  30.21 
 
 
319 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5900  rhodanese domain-containing protein  31.76 
 
 
303 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688028  normal  0.469982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3785  rhodanese-like protein  32.3 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  28.43 
 
 
281 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  26.69 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  30.69 
 
 
282 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  30.93 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  28.43 
 
 
279 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0562  Rhodanese domain protein  30.04 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1774  rhodanese domain-containing protein  31.67 
 
 
315 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.608218 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1396  rhodanese domain-containing protein  32.1 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260045  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  30.16 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  30.27 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  30.27 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  30.27 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 
366 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  30.49 
 
 
279 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  29.1 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.1 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  25.82 
 
 
280 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2738  rhodanese-related sulfurtransferase  31.69 
 
 
315 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.848314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  28.99 
 
 
321 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  27.72 
 
 
285 aa  110  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  28.46 
 
 
283 aa  109  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  29.27 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  29.89 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  30.16 
 
 
277 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  29.37 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  26.87 
 
 
277 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  28.9 
 
 
281 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  26.56 
 
 
287 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.52 
 
 
285 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  29.12 
 
 
301 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  28.28 
 
 
282 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2054  Rhodanese domain protein  28.97 
 
 
317 aa  107  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0105049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  27.59 
 
 
277 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1650  rhodanese domain-containing protein  29.71 
 
 
317 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  0.100041 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  29.76 
 
 
297 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  25.49 
 
 
279 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  27.93 
 
 
296 aa  105  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  29.34 
 
 
288 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  26.53 
 
 
289 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  28.35 
 
 
282 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  30.58 
 
 
308 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
275 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  29.6 
 
 
277 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  25.6 
 
 
281 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  29.6 
 
 
277 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  29.53 
 
 
290 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  27.12 
 
 
281 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  26.55 
 
 
279 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  28.01 
 
 
291 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.12 
 
 
286 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  27.3 
 
 
286 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  30.58 
 
 
647 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  28.74 
 
 
281 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  26.71 
 
 
283 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  25.51 
 
 
283 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  28.74 
 
 
275 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  26.8 
 
 
279 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  26.64 
 
 
284 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1047  Rhodanese domain protein  29.39 
 
 
289 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  28.85 
 
 
277 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  26.55 
 
 
282 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  27.76 
 
 
277 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  27.91 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2561  rhodanese domain-containing protein  27.92 
 
 
324 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.918662  normal  0.131407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  28.2 
 
 
291 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  28.06 
 
 
290 aa  99  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0689  rhodanese domain-containing protein  27.3 
 
 
291 aa  99  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.69 
 
 
286 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  25.67 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.01 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  28.79 
 
 
279 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.91 
 
 
283 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.94 
 
 
285 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  33.2 
 
 
290 aa  97.1  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  30.16 
 
 
282 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  26.58 
 
 
301 aa  97.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.4 
 
 
284 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  27.48 
 
 
286 aa  96.7  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  26.95 
 
 
286 aa  96.7  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.62 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  26.6 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.87 
 
 
299 aa  95.5  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  26.69 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  28.29 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.09 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  30.38 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.74 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.39 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  25.84 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  26.54 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>