More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0500 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0500  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
313 aa  638    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.346469  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3785  rhodanese-like protein  40.33 
 
 
303 aa  222  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5900  rhodanese domain-containing protein  40.76 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688028  normal  0.469982 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  41.26 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0346  rhodanese domain-containing protein  44.13 
 
 
333 aa  206  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0560  Rhodanese domain protein  34.01 
 
 
329 aa  150  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000058867  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1774  rhodanese domain-containing protein  34.39 
 
 
315 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.608218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2561  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 
324 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.918662  normal  0.131407 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1396  rhodanese domain-containing protein  35.66 
 
 
315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260045  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2738  rhodanese-related sulfurtransferase  35.31 
 
 
315 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.848314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0562  Rhodanese domain protein  34.8 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  30.17 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2054  Rhodanese domain protein  32.95 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0105049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1650  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 
317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  0.100041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  30.58 
 
 
283 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0792  rhodanese domain-containing protein  30.41 
 
 
325 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  31.79 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  30.42 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  29.59 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.59 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  31.29 
 
 
281 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.99 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  31.03 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  29.66 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.65 
 
 
284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  29.39 
 
 
297 aa  109  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  28.81 
 
 
283 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  31.06 
 
 
297 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  28.71 
 
 
291 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.39 
 
 
316 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  28.83 
 
 
284 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  28.72 
 
 
297 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  31.03 
 
 
277 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  29.14 
 
 
296 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  28.08 
 
 
290 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.97 
 
 
283 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  29.31 
 
 
279 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  28.67 
 
 
280 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  28.77 
 
 
284 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  28.72 
 
 
282 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  31.06 
 
 
301 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  29.1 
 
 
286 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  29.07 
 
 
287 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  29.45 
 
 
286 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.96 
 
 
286 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.72 
 
 
285 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  28.72 
 
 
277 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.16 
 
 
285 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  31.12 
 
 
288 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.62 
 
 
291 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  28.95 
 
 
296 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  29.18 
 
 
288 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  28.57 
 
 
279 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  29.9 
 
 
282 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.27 
 
 
292 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  29.9 
 
 
279 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  28.23 
 
 
281 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 
289 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  29.07 
 
 
277 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  29.29 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.67 
 
 
286 aa  99.8  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  28.42 
 
 
284 aa  99.4  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  31.49 
 
 
283 aa  99  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.44 
 
 
289 aa  99  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  29.9 
 
 
281 aa  99  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  27.12 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.33 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  28.42 
 
 
284 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  29.9 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  27.62 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  29.33 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  29.76 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.22 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.67 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  28.03 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  28.03 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  28.82 
 
 
279 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.87 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.46 
 
 
279 aa  97.1  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  29.05 
 
 
279 aa  97.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  27.46 
 
 
273 aa  96.7  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  33 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.52 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  29.76 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28290  rhodanese-related sulfurtransferase  32.71 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  29.21 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.97 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  28.19 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  28.32 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  27.72 
 
 
290 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  33.08 
 
 
289 aa  94  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  27.68 
 
 
282 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  27.99 
 
 
321 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.44 
 
 
285 aa  93.2  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.72 
 
 
280 aa  93.2  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  27.67 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  27.55 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  28.72 
 
 
275 aa  93.2  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  27.55 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>