More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5900 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5900  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  612  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688028  normal  0.469982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3785  rhodanese-like protein  80.53 
 
 		 303 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  43.26 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0500  rhodanese domain-containing protein  40.76 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.346469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0346  rhodanese domain-containing protein  40.36 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2561  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.918662  normal  0.131407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0562  Rhodanese domain protein  35.45 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2054  Rhodanese domain protein  34.8 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0105049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1650  rhodanese domain-containing protein  34.8 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  0.100041 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2738  rhodanese-related sulfurtransferase  37.64 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.848314  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1774  rhodanese domain-containing protein  34.9 
 
 		 315 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.608218 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1396  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0792  rhodanese domain-containing protein  36.94 
 
 		 325 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0560  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 		 329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000058867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  31.94 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  31.87 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  31.87 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  31.87 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  29.35 
 
 		 283 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  31.29 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  31.29 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  32.23 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  30.17 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  31.5 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  32.61 
 
 		 285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  32.48 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  31.87 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  29.21 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  30.4 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  31.67 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  31.14 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.85 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.71 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.85 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.79 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.91 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.91 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  31.42 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  32 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  31.49 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  28.52 
 
 		 286 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  31.12 
 
 		 282 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 278 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.39 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  28.22 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.62 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.09 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  31.01 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  29.3 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  30.6 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  30.1 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1647  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 		 343 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.368982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  29.93 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  31.02 
 
 		 279 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  32.36 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  29.86 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.36 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.14 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.35 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.42 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  31.22 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.32 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  27.63 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  31.14 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0454  Rhodanese domain protein  34.58 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.54 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  28.38 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  29.54 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  28.38 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  29.83 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  29.86 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  30.66 
 
 		 279 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  29.67 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  28.94 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  30.53 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.77 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  27.42 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  30.18 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  29.23 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7251  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.43 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0312238  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  29.97 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  27.5 
 
 		 272 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  32.12 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.43 
 
 		 289 aa  99.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  28.72 
 
 		 278 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  28.67 
 
 		 281 aa  99  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  31.5 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  28.72 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.7 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  29.17 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  27.86 
 
 		 273 aa  98.2  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  28.52 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  29.04 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  28.52 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  27.5 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>