More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0296 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
301 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  94.33 
 
 
282 aa  551  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  80.07 
 
 
277 aa  481  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  79.78 
 
 
277 aa  481  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  79 
 
 
283 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  80.87 
 
 
279 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  77.9 
 
 
277 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  77.9 
 
 
277 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  77.9 
 
 
277 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  78.29 
 
 
282 aa  471  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  80.8 
 
 
277 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  77.17 
 
 
277 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  77.17 
 
 
277 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  76.24 
 
 
281 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  74.36 
 
 
275 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  73.91 
 
 
275 aa  438  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  73.57 
 
 
287 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  73.02 
 
 
279 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  75.09 
 
 
279 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  71.84 
 
 
279 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  71.53 
 
 
281 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  73.29 
 
 
279 aa  418  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  74.28 
 
 
279 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  73.29 
 
 
279 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  72.46 
 
 
277 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  72.1 
 
 
277 aa  404  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  58.52 
 
 
288 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  56.93 
 
 
280 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  51.69 
 
 
305 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  54.98 
 
 
283 aa  308  8e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  53.45 
 
 
297 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  55.64 
 
 
289 aa  306  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  51 
 
 
312 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  51.96 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  53.99 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  53.99 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  53.99 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  54.35 
 
 
297 aa  302  5.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  54.04 
 
 
281 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  53.68 
 
 
281 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  51.44 
 
 
286 aa  299  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  55.07 
 
 
306 aa  298  7e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  50.92 
 
 
286 aa  297  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  50.36 
 
 
285 aa  295  9e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  53.6 
 
 
301 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  53.07 
 
 
297 aa  290  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  51.82 
 
 
321 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  52.17 
 
 
304 aa  286  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  52.5 
 
 
285 aa  285  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  51.29 
 
 
308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  52.28 
 
 
305 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  52.17 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  52.17 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  53.6 
 
 
297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  51.81 
 
 
297 aa  281  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  52.71 
 
 
297 aa  281  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  54.02 
 
 
303 aa  280  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  50.18 
 
 
291 aa  279  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  50.87 
 
 
304 aa  279  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  52.84 
 
 
307 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  49.82 
 
 
355 aa  275  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  50 
 
 
297 aa  272  6e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  48.38 
 
 
282 aa  271  7e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  48.72 
 
 
340 aa  266  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  46.69 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  48.63 
 
 
295 aa  262  6e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  47 
 
 
285 aa  256  3e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  46.02 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  44.79 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  45.3 
 
 
296 aa  242  6e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  44.88 
 
 
289 aa  237  1e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  39.93 
 
 
366 aa  209  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  38.43 
 
 
273 aa  199  5e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  39.63 
 
 
267 aa  178  9e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  38.85 
 
 
283 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  34.81 
 
 
277 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  33.09 
 
 
282 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  31.03 
 
 
314 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  32.16 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  32.39 
 
 
291 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  30.51 
 
 
258 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30 
 
 
285 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.21 
 
 
283 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  31.45 
 
 
286 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  31.01 
 
 
288 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30 
 
 
285 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.93 
 
 
286 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.89 
 
 
291 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  30.63 
 
 
282 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.63 
 
 
282 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  29.18 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.69 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  31.47 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  34.52 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.5 
 
 
279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  32.33 
 
 
284 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 
289 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.62 
 
 
285 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  28.14 
 
 
305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>