More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3547 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 
277 aa  568  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  88.04 
 
 
279 aa  504  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  85.14 
 
 
277 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  85.56 
 
 
277 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  83.03 
 
 
277 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  83.03 
 
 
277 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  81.95 
 
 
277 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  81.95 
 
 
277 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  81.95 
 
 
277 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  80.8 
 
 
301 aa  474  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  80.43 
 
 
282 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  77.17 
 
 
281 aa  451  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  77.37 
 
 
275 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  76.09 
 
 
282 aa  447  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  75 
 
 
283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  76.09 
 
 
279 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  75.81 
 
 
275 aa  437  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  75.09 
 
 
287 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  74.64 
 
 
279 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  73.91 
 
 
279 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  73.55 
 
 
281 aa  424  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  74.28 
 
 
279 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  75.09 
 
 
279 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  74.28 
 
 
279 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  71.12 
 
 
277 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  71.48 
 
 
277 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  59.64 
 
 
288 aa  345  7e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  57.82 
 
 
280 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  55.4 
 
 
289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  52.82 
 
 
296 aa  308  6.999999999999999e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  53.99 
 
 
286 aa  306  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  52.9 
 
 
283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  54.21 
 
 
297 aa  298  5e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  52.31 
 
 
286 aa  298  8e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  51.43 
 
 
285 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  54.12 
 
 
285 aa  294  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  54.8 
 
 
297 aa  293  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  54.04 
 
 
355 aa  292  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  53.76 
 
 
297 aa  292  4e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  53.09 
 
 
308 aa  292  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  51.81 
 
 
281 aa  289  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  51.45 
 
 
281 aa  289  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  51.96 
 
 
293 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  51.96 
 
 
293 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  50.18 
 
 
305 aa  284  9e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  52.96 
 
 
321 aa  284  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  52.21 
 
 
340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  50.72 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  50.72 
 
 
312 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  51.45 
 
 
298 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  50.54 
 
 
301 aa  280  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  51.45 
 
 
298 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  51.45 
 
 
298 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  49.1 
 
 
281 aa  280  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  52.33 
 
 
297 aa  279  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  51.44 
 
 
306 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  49.46 
 
 
291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  49.46 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  50.53 
 
 
307 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 
303 aa  267  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  49.1 
 
 
297 aa  266  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  49.65 
 
 
305 aa  265  5.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  47.65 
 
 
304 aa  263  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  48.23 
 
 
304 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  48.01 
 
 
297 aa  259  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  47.24 
 
 
295 aa  257  1e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  46.34 
 
 
290 aa  256  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  46.62 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  47.4 
 
 
296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  45.94 
 
 
293 aa  250  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  45.74 
 
 
289 aa  246  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  41.73 
 
 
366 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  39.63 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  37.64 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 
283 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  32.5 
 
 
282 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  32.74 
 
 
281 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 
258 aa  135  8e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.45 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  32.4 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  32.3 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02674  thiosulfate sulfurtransferase  38.57 
 
 
327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  31.6 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  30.94 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 
280 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.45 
 
 
283 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  31.5 
 
 
288 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  32.03 
 
 
280 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  30.07 
 
 
477 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.17 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  31.36 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  29.35 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  30.42 
 
 
284 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.8 
 
 
285 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  28.21 
 
 
270 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  30.42 
 
 
284 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  32.17 
 
 
282 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  29.72 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.91 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>