More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3785 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3785  rhodanese-like protein  100 
 
 
303 aa  614  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5900  rhodanese domain-containing protein  80.53 
 
 
303 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688028  normal  0.469982 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  42.55 
 
 
319 aa  242  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0500  rhodanese domain-containing protein  40.33 
 
 
313 aa  222  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.346469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0346  rhodanese domain-containing protein  41.01 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2561  rhodanese domain-containing protein  36.55 
 
 
324 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.918662  normal  0.131407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2054  Rhodanese domain protein  34.71 
 
 
317 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0105049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1650  rhodanese domain-containing protein  34.23 
 
 
317 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  0.100041 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2738  rhodanese-related sulfurtransferase  39.58 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.848314  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1396  rhodanese domain-containing protein  37.94 
 
 
315 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260045  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1774  rhodanese domain-containing protein  36.13 
 
 
315 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.608218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0562  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
331 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0792  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 
325 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0560  Rhodanese domain protein  32.3 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000058867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  31.56 
 
 
277 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  31.56 
 
 
277 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  31.56 
 
 
277 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  32.51 
 
 
279 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  29.79 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  29.79 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  31.54 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  30.96 
 
 
284 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  29.79 
 
 
277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  30.5 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  31.45 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  28.81 
 
 
291 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  31.45 
 
 
279 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  30.77 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  28.42 
 
 
283 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  30.5 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.1 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.93 
 
 
316 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1647  rhodanese domain-containing protein  31.79 
 
 
343 aa  109  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.368982  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  31.72 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.68 
 
 
284 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  29.68 
 
 
284 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  31.34 
 
 
281 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.68 
 
 
284 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  29.67 
 
 
283 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  30.74 
 
 
281 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  28.95 
 
 
321 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  29.43 
 
 
282 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0454  Rhodanese domain protein  34.76 
 
 
298 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  28.98 
 
 
288 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  28.95 
 
 
321 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  30.18 
 
 
285 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  30.6 
 
 
287 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30 
 
 
282 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  30 
 
 
282 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  32.17 
 
 
275 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  28.73 
 
 
286 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.52 
 
 
291 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  28.26 
 
 
283 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.12 
 
 
283 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  27.8 
 
 
301 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.01 
 
 
286 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  29.69 
 
 
297 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  28.97 
 
 
281 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  28.92 
 
 
283 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  29.23 
 
 
278 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.02 
 
 
289 aa  102  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  30.14 
 
 
279 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  28.52 
 
 
275 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  29.84 
 
 
290 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.56 
 
 
285 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.76 
 
 
285 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  30.07 
 
 
286 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  28.77 
 
 
288 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  28.11 
 
 
282 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  26.78 
 
 
281 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 
282 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.78 
 
 
287 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  29.43 
 
 
280 aa  99.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  29.51 
 
 
281 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.84 
 
 
285 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  29.61 
 
 
297 aa  99.4  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.83 
 
 
292 aa  99.4  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  28.37 
 
 
297 aa  99  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7251  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.14 
 
 
292 aa  99  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0312238  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  27.87 
 
 
282 aa  99  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  25.64 
 
 
272 aa  99  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  27.34 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  26.79 
 
 
272 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  27.87 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  27.36 
 
 
282 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  26.37 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  28.18 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  27.72 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  28.72 
 
 
273 aa  97.1  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  27.34 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
291 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.4 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
366 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.62 
 
 
285 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  25.7 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  25.7 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  28.27 
 
 
279 aa  95.9  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1954  Rhodanese domain protein  29.08 
 
 
335 aa  95.9  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.535428 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.17 
 
 
285 aa  95.9  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  29.86 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>