More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5914 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 
283 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  63.21 
 
 
286 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  46.18 
 
 
283 aa  252  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.07 
 
 
285 aa  251  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  45.2 
 
 
282 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 
281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.88 
 
 
286 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.77 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.62 
 
 
285 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  43.77 
 
 
282 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.77 
 
 
282 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  44.52 
 
 
292 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  44.98 
 
 
284 aa  235  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.51 
 
 
286 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.35 
 
 
285 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  42.91 
 
 
286 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  40.66 
 
 
282 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  41.84 
 
 
289 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  42.2 
 
 
289 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  41.13 
 
 
287 aa  222  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  43.64 
 
 
280 aa  222  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  43.73 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  42.55 
 
 
284 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  42.55 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.64 
 
 
283 aa  218  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.64 
 
 
285 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.53 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  40.36 
 
 
284 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  41.09 
 
 
286 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  41.84 
 
 
477 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.99 
 
 
291 aa  216  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  39.64 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.01 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  40 
 
 
284 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  39.64 
 
 
281 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 
284 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.49 
 
 
289 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  42.07 
 
 
282 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.63 
 
 
289 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  41.3 
 
 
281 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  40.96 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  40.59 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  37.96 
 
 
281 aa  195  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
288 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.57 
 
 
289 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.11 
 
 
284 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.28 
 
 
281 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.87 
 
 
284 aa  192  8e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  37.87 
 
 
284 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.5 
 
 
284 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.56 
 
 
281 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 
281 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.56 
 
 
281 aa  189  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.2 
 
 
281 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  36.56 
 
 
281 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.56 
 
 
281 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.56 
 
 
281 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.2 
 
 
281 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.83 
 
 
289 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.84 
 
 
280 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.84 
 
 
280 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.84 
 
 
280 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.84 
 
 
280 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.2 
 
 
281 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.84 
 
 
280 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.07 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40 
 
 
276 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  35.79 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.69 
 
 
284 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  35.89 
 
 
290 aa  175  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  38.18 
 
 
291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 
288 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1047  Rhodanese domain protein  36.49 
 
 
289 aa  168  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  37 
 
 
290 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  34.75 
 
 
278 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.99 
 
 
282 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10395  thiosulfate sulfurtransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01370)  33.9 
 
 
344 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  35.51 
 
 
304 aa  158  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  33.94 
 
 
276 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.06 
 
 
283 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  31.69 
 
 
277 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  31.69 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  35.56 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  34.32 
 
 
276 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  31.45 
 
 
277 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  35.14 
 
 
285 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  30.51 
 
 
276 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  31.12 
 
 
277 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  34.19 
 
 
272 aa  149  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  31.12 
 
 
277 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  31.12 
 
 
277 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  32.86 
 
 
276 aa  149  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  31.12 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  30.28 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  30.99 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  30.28 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28290  rhodanese-related sulfurtransferase  34.67 
 
 
310 aa  145  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.18 
 
 
276 aa  145  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  33.8 
 
 
291 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>