More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0562 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  100 
 
 		 276 aa  581  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  55.51 
 
 		 276 aa  321  6e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  53.87 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.8 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1088  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.26 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73004  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3019  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.68 
 
 		 277 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  43.37 
 
 		 276 aa  256  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.95 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1192  rhodanese domain-containing protein  44.91 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0358282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  44.25 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.41 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1160  rhodanese domain-containing protein  44.21 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.9 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3198  Rhodanese domain protein  44.56 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.88 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.96 
 
 		 289 aa  235  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.58 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  39.57 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.700254 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.01 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  41.01 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.01 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  41.01 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.01 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.01 
 
 		 281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  39.35 
 
 		 282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  39.43 
 
 		 282 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.65 
 
 		 281 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.01 
 
 		 281 aa  211  9e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.65 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  38.99 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  39.27 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  39.93 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  39.93 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.49 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  40.29 
 
 		 280 aa  205  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  39.21 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  39.63 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  38.49 
 
 		 280 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.56 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  37 
 
 		 477 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.35 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.64 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.13 
 
 		 286 aa  198  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.64 
 
 		 280 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.64 
 
 		 280 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.64 
 
 		 280 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.64 
 
 		 280 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  37.09 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  41.16 
 
 		 284 aa  195  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  38.93 
 
 		 283 aa  195  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  38.13 
 
 		 292 aa  195  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.63 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  37.63 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  38.57 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.21 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.63 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  39.43 
 
 		 284 aa  192  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  39.32 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  37.82 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  35.59 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.49 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 284 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37 
 
 		 284 aa  188  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.68 
 
 		 289 aa  188  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.59 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.96 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  38.13 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.13 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 284 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.35 
 
 		 316 aa  184  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  34.91 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.17 
 
 		 285 aa  178  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.46 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.86 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.05 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.59 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.72 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  33.69 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  37.23 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  34.75 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.64 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  32.86 
 
 		 283 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.92 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10395  thiosulfate sulfurtransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01370)  38.15 
 
 		 344 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  36.53 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  34.66 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60020  thiosulfate sulfurtransferase  36.51 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.509685  normal  0.0271874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 		 284 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  31.45 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1101  rhodanese domain-containing protein  48.06 
 
 		 133 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.84 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.58 
 
 		 284 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  33.95 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>