More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01483 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.54 
 
 
283 aa  221  9e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  44.87 
 
 
276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  41.7 
 
 
276 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.8 
 
 
284 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.34 
 
 
283 aa  201  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  42.31 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 
284 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  39.32 
 
 
276 aa  192  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3198  Rhodanese domain protein  38.35 
 
 
285 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1192  rhodanese domain-containing protein  38.35 
 
 
285 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0358282  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.8 
 
 
276 aa  189  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1160  rhodanese domain-containing protein  38.35 
 
 
285 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1088  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.61 
 
 
285 aa  187  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73004  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  40.52 
 
 
289 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  40.09 
 
 
289 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.28 
 
 
291 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  38.02 
 
 
281 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  39.15 
 
 
283 aa  185  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  41.7 
 
 
282 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.7 
 
 
282 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.97 
 
 
285 aa  184  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  39 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  38.62 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3019  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.25 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  42.13 
 
 
282 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  37.04 
 
 
276 aa  181  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.53 
 
 
286 aa  181  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  39.24 
 
 
284 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  38.21 
 
 
282 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  41.38 
 
 
281 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.46 
 
 
285 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  38.08 
 
 
285 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  38.82 
 
 
284 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  38.79 
 
 
281 aa  178  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.92 
 
 
285 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  39.66 
 
 
284 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  38.17 
 
 
287 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.36 
 
 
285 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  39.17 
 
 
281 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  37.71 
 
 
286 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 
284 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.78 
 
 
287 aa  175  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.72 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 
286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.08 
 
 
285 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  39.57 
 
 
292 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  38.4 
 
 
477 aa  171  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  39.22 
 
 
284 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.82 
 
 
285 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  37.15 
 
 
284 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  36.91 
 
 
284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  35.57 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.04 
 
 
281 aa  161  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.33 
 
 
284 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.32 
 
 
289 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  34.39 
 
 
280 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.66 
 
 
284 aa  158  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 
288 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.61 
 
 
316 aa  156  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.82 
 
 
281 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.4 
 
 
281 aa  155  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  36.4 
 
 
281 aa  155  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  36.4 
 
 
281 aa  155  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.4 
 
 
281 aa  155  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.4 
 
 
281 aa  155  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.4 
 
 
281 aa  155  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.4 
 
 
281 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.98 
 
 
281 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.29 
 
 
289 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.66 
 
 
280 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.66 
 
 
280 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.66 
 
 
280 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.66 
 
 
280 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.66 
 
 
280 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.61 
 
 
284 aa  149  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.05 
 
 
289 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 
284 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.61 
 
 
284 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.76 
 
 
289 aa  148  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.88 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.45 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.98 
 
 
285 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  34.57 
 
 
283 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  33.47 
 
 
304 aa  137  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60020  thiosulfate sulfurtransferase  34.66 
 
 
310 aa  135  9e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.509685  normal  0.0271874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 
286 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10395  thiosulfate sulfurtransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01370)  32.39 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  32.34 
 
 
286 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 
291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.68 
 
 
285 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  36.11 
 
 
280 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  36.28 
 
 
285 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  33.79 
 
 
285 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 
312 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.2 
 
 
287 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  35.81 
 
 
300 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  34.89 
 
 
278 aa  121  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.2 
 
 
299 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.77 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>