More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2742 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  100 
 
 
284 aa  577  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  73.17 
 
 
289 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  72.47 
 
 
289 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  67.25 
 
 
284 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  58.33 
 
 
281 aa  338  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.43 
 
 
281 aa  319  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.07 
 
 
281 aa  318  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  55.07 
 
 
281 aa  318  6e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  55.07 
 
 
281 aa  318  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.07 
 
 
281 aa  318  6e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.07 
 
 
281 aa  318  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.07 
 
 
281 aa  318  6e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  54.71 
 
 
281 aa  316  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.07 
 
 
280 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.07 
 
 
280 aa  313  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.07 
 
 
280 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  54.35 
 
 
281 aa  314  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.07 
 
 
280 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.07 
 
 
280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  49.46 
 
 
286 aa  289  4e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  48.38 
 
 
284 aa  288  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.38 
 
 
284 aa  288  6e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.01 
 
 
284 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  46.49 
 
 
281 aa  269  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  50.71 
 
 
286 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  45.55 
 
 
284 aa  266  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  50.54 
 
 
280 aa  265  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  49.82 
 
 
280 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  46.95 
 
 
282 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  45.2 
 
 
282 aa  256  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  45.2 
 
 
282 aa  254  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  44.91 
 
 
477 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  48.2 
 
 
281 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  45.42 
 
 
289 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  43.77 
 
 
284 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.24 
 
 
285 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  44.72 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  42.4 
 
 
287 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  44.04 
 
 
283 aa  242  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.91 
 
 
285 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  43.75 
 
 
284 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  43.75 
 
 
284 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.68 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.86 
 
 
286 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  45.49 
 
 
282 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.49 
 
 
282 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  41.28 
 
 
281 aa  232  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.77 
 
 
285 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  42.7 
 
 
284 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  43.11 
 
 
281 aa  228  9e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  44.04 
 
 
282 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.6 
 
 
289 aa  226  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  42.24 
 
 
288 aa  226  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.24 
 
 
283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  42.24 
 
 
292 aa  221  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.52 
 
 
279 aa  221  9e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  45.19 
 
 
284 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.65 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  40.93 
 
 
284 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.7 
 
 
291 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.65 
 
 
286 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.6 
 
 
316 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.04 
 
 
289 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  35.69 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.68 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  41.16 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  39.13 
 
 
286 aa  195  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  37.01 
 
 
276 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  36.33 
 
 
276 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  35.21 
 
 
283 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  36.33 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.06 
 
 
285 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  34.66 
 
 
276 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 
285 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.86 
 
 
283 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.92 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.92 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.72 
 
 
276 aa  172  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.43 
 
 
284 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  33.09 
 
 
304 aa  169  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10395  thiosulfate sulfurtransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01370)  35.67 
 
 
344 aa  169  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1192  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 
285 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0358282  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3198  Rhodanese domain protein  36.88 
 
 
285 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1088  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.59 
 
 
285 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73004  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1160  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 
285 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 
278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  37.63 
 
 
288 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  35.97 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  33.57 
 
 
276 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3019  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.17 
 
 
277 aa  158  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1047  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 
289 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60020  thiosulfate sulfurtransferase  34.89 
 
 
310 aa  151  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.509685  normal  0.0271874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 
291 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17215  predicted protein  36.74 
 
 
297 aa  143  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  34.77 
 
 
280 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  36.18 
 
 
283 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  32.73 
 
 
290 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  35.69 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  37.33 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>