More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28290 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_28290  rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 
310 aa  605  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0454  Rhodanese domain protein  60.13 
 
 
298 aa  311  9e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1047  Rhodanese domain protein  39.02 
 
 
289 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7251  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.85 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0312238  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.82 
 
 
285 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  35.74 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.68 
 
 
285 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  34.67 
 
 
283 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.5 
 
 
316 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  35.1 
 
 
286 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.98 
 
 
283 aa  142  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  35.31 
 
 
291 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  34.96 
 
 
284 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  36.24 
 
 
292 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.59 
 
 
285 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  33.77 
 
 
288 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.79 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.48 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  32.27 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  30.46 
 
 
276 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  34.32 
 
 
282 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.32 
 
 
282 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.36 
 
 
285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  31.01 
 
 
284 aa  129  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 
288 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  29.61 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.15 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  34.49 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  32.9 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.5 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.57 
 
 
287 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  35.02 
 
 
295 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
278 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  31.51 
 
 
286 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.27 
 
 
289 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 
300 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.66 
 
 
285 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 
282 aa  123  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  33 
 
 
286 aa  122  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.51 
 
 
284 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  31.45 
 
 
284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.77 
 
 
291 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.33 
 
 
281 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 
284 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  32.87 
 
 
289 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.33 
 
 
283 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  36.3 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  34.92 
 
 
282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  32.87 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  32.5 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.46 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  31.9 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  32.34 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  31.71 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 
277 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  30.64 
 
 
277 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.33 
 
 
289 aa  116  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.62 
 
 
300 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.05 
 
 
289 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 
304 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.68 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  35.45 
 
 
280 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  29.47 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10395  thiosulfate sulfurtransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01370)  29.81 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  35.17 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  37.12 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  36.29 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  29.66 
 
 
255 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.04 
 
 
287 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  30.64 
 
 
277 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  31.36 
 
 
284 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  34.17 
 
 
280 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  28.67 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.94 
 
 
280 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.94 
 
 
280 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.48 
 
 
276 aa  113  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.54 
 
 
299 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3278  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.44 
 
 
330 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
282 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.53 
 
 
292 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  31.44 
 
 
281 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.64 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  31.64 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.77 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.64 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.64 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  31.64 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.64 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.94 
 
 
280 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  32.81 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  30.49 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.6 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  28.28 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.6 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>