More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0312 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
281 aa  580  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  97.86 
 
 
281 aa  569  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  83.99 
 
 
283 aa  494  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  68.07 
 
 
293 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  68.07 
 
 
293 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  68.55 
 
 
289 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  64.77 
 
 
285 aa  388  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  65.52 
 
 
296 aa  384  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  64.54 
 
 
301 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  67.38 
 
 
306 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  64.06 
 
 
286 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  64.18 
 
 
297 aa  374  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  61.32 
 
 
307 aa  362  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  62.45 
 
 
286 aa  358  5e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  62.02 
 
 
303 aa  355  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  62.86 
 
 
312 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  62.14 
 
 
298 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  62.86 
 
 
297 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  62.14 
 
 
298 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  62.14 
 
 
298 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  62.14 
 
 
305 aa  352  4e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  60.42 
 
 
291 aa  351  5.9999999999999994e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  62.82 
 
 
304 aa  349  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  58.27 
 
 
288 aa  348  6e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  59.79 
 
 
305 aa  346  3e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  60.14 
 
 
297 aa  343  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  63.93 
 
 
297 aa  342  4e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  59.23 
 
 
304 aa  338  5.9999999999999996e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  59.27 
 
 
280 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  57.4 
 
 
281 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  52.54 
 
 
277 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  52.54 
 
 
277 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  52.54 
 
 
277 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  54.09 
 
 
281 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  57.82 
 
 
277 aa  308  8e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  55.23 
 
 
275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  54.78 
 
 
279 aa  305  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  53.43 
 
 
277 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  54.71 
 
 
279 aa  305  7e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  54.04 
 
 
287 aa  304  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  53.99 
 
 
279 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  52.4 
 
 
282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  54.98 
 
 
279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  51.99 
 
 
277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  52.54 
 
 
279 aa  301  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  55.8 
 
 
279 aa  301  9e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  54.04 
 
 
301 aa  300  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  52.92 
 
 
275 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  53.74 
 
 
285 aa  300  2e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  51.81 
 
 
281 aa  299  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  56.2 
 
 
277 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  54.48 
 
 
282 aa  295  5e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  52.57 
 
 
282 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  51.64 
 
 
283 aa  292  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  52.07 
 
 
293 aa  292  4e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  52.25 
 
 
295 aa  292  4e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  51.81 
 
 
277 aa  292  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  51.81 
 
 
277 aa  292  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  53.62 
 
 
279 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  51.81 
 
 
277 aa  289  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  50.17 
 
 
289 aa  281  8.000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  49.45 
 
 
355 aa  278  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  49.08 
 
 
340 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  47.74 
 
 
321 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  50 
 
 
297 aa  265  4e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  48.19 
 
 
308 aa  265  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  49.3 
 
 
297 aa  264  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  49.46 
 
 
285 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  48.93 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  46.96 
 
 
296 aa  244  9e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  43.9 
 
 
290 aa  235  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  41.99 
 
 
277 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  41.16 
 
 
366 aa  217  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 
282 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  40.36 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  38.78 
 
 
291 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  34.63 
 
 
321 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  34.63 
 
 
321 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  37.72 
 
 
267 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  36.64 
 
 
270 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  31.49 
 
 
314 aa  155  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  29.17 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  34.66 
 
 
276 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  33.68 
 
 
320 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  33.1 
 
 
271 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  33.81 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.51 
 
 
285 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  35.34 
 
 
273 aa  139  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.22 
 
 
287 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  30.43 
 
 
321 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  32.75 
 
 
271 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  33.8 
 
 
286 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  33.45 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  29.75 
 
 
258 aa  132  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.21 
 
 
285 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  33.93 
 
 
647 aa  132  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.15 
 
 
285 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.5 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.5 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>