More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2079 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
340 aa  685    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  88.95 
 
 
355 aa  608  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  66.19 
 
 
308 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  61.72 
 
 
321 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  56.3 
 
 
280 aa  315  6e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  51.09 
 
 
282 aa  292  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  52.57 
 
 
277 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  52.57 
 
 
277 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  52.57 
 
 
277 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  51.84 
 
 
288 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  52.94 
 
 
277 aa  289  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  52.38 
 
 
279 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  52.94 
 
 
277 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  52.21 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  52.01 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  53.68 
 
 
279 aa  282  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  52.21 
 
 
277 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  52.21 
 
 
277 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  53.14 
 
 
279 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  49.08 
 
 
281 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  49.08 
 
 
281 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  49.26 
 
 
281 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  51.1 
 
 
279 aa  272  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  50.18 
 
 
283 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  52.03 
 
 
279 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 
286 aa  269  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  49.82 
 
 
287 aa  268  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  50.18 
 
 
277 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  49.26 
 
 
279 aa  267  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  48.72 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  48.25 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  48.71 
 
 
282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  50.18 
 
 
279 aa  266  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  50.72 
 
 
285 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 
286 aa  265  7e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  50.92 
 
 
275 aa  265  7e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  48.53 
 
 
281 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  50.36 
 
 
282 aa  261  1e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  45.65 
 
 
297 aa  259  4e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  48.01 
 
 
277 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  45.65 
 
 
297 aa  257  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  47.37 
 
 
293 aa  257  3e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  47.39 
 
 
290 aa  256  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  47.06 
 
 
275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  47.45 
 
 
289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  47.81 
 
 
281 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  44.93 
 
 
285 aa  251  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  45.58 
 
 
293 aa  249  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  45.58 
 
 
293 aa  249  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  45.85 
 
 
291 aa  249  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  47.35 
 
 
295 aa  248  1e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  47.06 
 
 
297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  44.33 
 
 
297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  46.07 
 
 
285 aa  243  5e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  48.16 
 
 
301 aa  242  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  46.69 
 
 
304 aa  242  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  46.62 
 
 
307 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  48.19 
 
 
306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  46.24 
 
 
304 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  46.74 
 
 
305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  46.89 
 
 
297 aa  232  6e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  44.8 
 
 
289 aa  232  7.000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  44.12 
 
 
305 aa  229  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  44.53 
 
 
297 aa  228  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  46.76 
 
 
303 aa  227  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  43.36 
 
 
296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  45.02 
 
 
297 aa  225  6e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  42.28 
 
 
298 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  42.28 
 
 
298 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  42.28 
 
 
298 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  37.55 
 
 
273 aa  179  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  35.06 
 
 
277 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
366 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  36.68 
 
 
291 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 
282 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 
283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 
281 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.44 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.14 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.74 
 
 
285 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  35.36 
 
 
288 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  35.36 
 
 
289 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  33.69 
 
 
286 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  33.57 
 
 
281 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.71 
 
 
286 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.29 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  34.14 
 
 
286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  32.31 
 
 
477 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.4 
 
 
289 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.15 
 
 
286 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  29.52 
 
 
321 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  29.52 
 
 
321 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  36.5 
 
 
282 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.5 
 
 
282 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.32 
 
 
281 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.32 
 
 
281 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  30.32 
 
 
281 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.32 
 
 
281 aa  135  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  30.32 
 
 
281 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>