255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1462 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 419 aa  820    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 		 647 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.52 
 
 		 218 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  43.06 
 
 		 218 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  43.9 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  45.31 
 
 		 218 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  50.28 
 
 		 237 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.58 
 
 		 218 aa  126  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 		 189 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  42.47 
 
 		 189 aa  106  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.58 
 
 		 197 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.8 
 
 		 175 aa  98.6  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  37.57 
 
 		 175 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  34.52 
 
 		 186 aa  93.6  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  33.71 
 
 		 185 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.96 
 
 		 174 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.91 
 
 		 185 aa  87  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  34.3 
 
 		 185 aa  86.3  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.41 
 
 		 176 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.39 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  40.67 
 
 		 192 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  30.81 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  30.89 
 
 		 175 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.49 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  36.19 
 
 		 128 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.74 
 
 		 183 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  36.19 
 
 		 128 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  27.61 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  31.1 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 180 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 		 170 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2629  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 		 108 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  27.54 
 
 		 144 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.67 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  25.41 
 
 		 252 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37 
 
 		 140 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  35.9 
 
 		 132 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  36.18 
 
 		 173 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3484  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.65 
 
 		 561 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0342  rhodanese domain-containing protein  35.4 
 
 		 225 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 177 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.29 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  34.15 
 
 		 141 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.03 
 
 		 393 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  36.14 
 
 		 140 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.91 
 
 		 390 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  34.57 
 
 		 138 aa  53.1  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 		 153 aa  53.1  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.21 
 
 		 568 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  34.62 
 
 		 137 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  42.5 
 
 		 361 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2370  Rhodanese domain protein  37.4 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000188451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.73 
 
 		 141 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  27.54 
 
 		 144 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  37.35 
 
 		 221 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  27.87 
 
 		 278 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 221 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 221 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  27.74 
 
 		 144 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.74 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  37.11 
 
 		 896 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  29.76 
 
 		 151 aa  50.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  38.54 
 
 		 199 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 		 150 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  32.14 
 
 		 247 aa  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 		 192 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 		 141 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2508  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 		 149 aa  50.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.61 
 
 		 368 aa  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  35.14 
 
 		 121 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 225 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 225 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  32.04 
 
 		 136 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  33.73 
 
 		 151 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 178 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 		 194 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 124 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.63 
 
 		 361 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  30.67 
 
 		 185 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  33.73 
 
 		 135 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  27.74 
 
 		 144 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 		 189 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 		 141 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  41.75 
 
 		 124 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  27.74 
 
 		 144 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  25.16 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  28.89 
 
 		 123 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  32.61 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 173 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  38.1 
 
 		 535 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  28.1 
 
 		 137 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  35.96 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  28.4 
 
 		 150 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  27.74 
 
 		 144 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  32.61 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  35.96 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  27.74 
 
 		 158 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>