79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1696 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 		 185 aa  357  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  44.63 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  52.08 
 
 		 175 aa  137  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  44.63 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.43 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.39 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.48 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  40.83 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  39.63 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.31 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.44 
 
 		 175 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  45.28 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 		 419 aa  90.5  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  36.09 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  37.58 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  43.75 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  38 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.32 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  33.76 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  34.13 
 
 		 344 aa  74.7  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.57 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.12 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  34.07 
 
 		 373 aa  65.5  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.93 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  30.4 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  31.03 
 
 		 399 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.23 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.69 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  30.23 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  27.87 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  29.69 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.92 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  30.3 
 
 		 137 aa  52.4  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  32.2 
 
 		 647 aa  52  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.75 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.52 
 
 		 332 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  30.71 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.47 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.47 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  33.67 
 
 		 344 aa  48.5  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  25.93 
 
 		 141 aa  48.5  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.95 
 
 		 153 aa  48.5  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  25.93 
 
 		 141 aa  48.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.34 
 
 		 371 aa  48.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.08 
 
 		 138 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.440254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  31.16 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  28.93 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.58 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.81 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1941  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.83 
 
 		 371 aa  45.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.368246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  26.53 
 
 		 371 aa  44.7  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  27.21 
 
 		 373 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2496  integral membrane protein  29.13 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.71 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.61 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.58 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3903  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.75 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0456636  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.78 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.46 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4263  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.97 
 
 		 400 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409839  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  30.89 
 
 		 354 aa  43.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0328  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.78 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.63 
 
 		 330 aa  42.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.08 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.522142  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  28.87 
 
 		 394 aa  42.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 		 354 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.09 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1915  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.09 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0232  YeeE/YedE  31.71 
 
 		 143 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2717  putative transmembrane protein  37.23 
 
 		 145 aa  42  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.430546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.54 
 
 		 139 aa  42  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.36 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1336  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.61 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377918 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5569  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.83 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0380348  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  29.7 
 
 		 385 aa  41.2  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>