65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6935 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
167 aa  333  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  70.95 
 
 
152 aa  219  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  69.8 
 
 
159 aa  218  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.09 
 
 
159 aa  189  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  57.14 
 
 
136 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52.55 
 
 
138 aa  147  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0268  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56 
 
 
172 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  48.91 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.72 
 
 
138 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  48.51 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2677  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.88 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  33.07 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.59 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.76 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  29.77 
 
 
149 aa  61.6  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2076  hypothetical protein  33.93 
 
 
148 aa  57.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  33.87 
 
 
205 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1998  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.93 
 
 
148 aa  57.8  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  27.14 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  33.98 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.12 
 
 
149 aa  55.5  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.12 
 
 
153 aa  54.3  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.16 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.07 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  33.64 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  25.74 
 
 
141 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  32.04 
 
 
175 aa  52  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.43 
 
 
153 aa  52  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.18 
 
 
176 aa  52  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  29.71 
 
 
140 aa  51.6  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3388  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.99 
 
 
290 aa  51.2  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530669  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.26 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.7 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2106  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.58 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.653273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  27.18 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  30.58 
 
 
186 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.5 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  27.41 
 
 
373 aa  47  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.81 
 
 
185 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2437  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.56 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224187  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4716  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.67 
 
 
142 aa  45.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3633  hypothetical protein  27.61 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01940  hypothetical protein  30.11 
 
 
139 aa  44.7  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1408  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.81 
 
 
140 aa  44.3  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.56 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.440254  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.82 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  27.18 
 
 
399 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0232  YeeE/YedE  28.7 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  27.05 
 
 
647 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.47 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6242  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.23 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937255  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6794  hypothetical protein  37.68 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.47 
 
 
137 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2078  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.86 
 
 
144 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1617  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.35 
 
 
155 aa  41.2  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000235117  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1915  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.86 
 
 
163 aa  41.2  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2447  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.43 
 
 
142 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0437  hypothetical protein  32.1 
 
 
137 aa  41.2  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.275295 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.78 
 
 
332 aa  41.2  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1684  YeeE/YedE  27.59 
 
 
168 aa  40.8  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3646  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.42 
 
 
142 aa  40.8  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.415893  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  26.5 
 
 
143 aa  40.8  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3749  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.29 
 
 
136 aa  40.4  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>