96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0103 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  312  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  49.64 
 
 
137 aa  157  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 
138 aa  156  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2677  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  58.4 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.44 
 
 
152 aa  148  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  47.45 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.38 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.28 
 
 
138 aa  144  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  49.64 
 
 
137 aa  142  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  48.55 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.36 
 
 
167 aa  138  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0268  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.25 
 
 
172 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.4 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  34.78 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.61 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.09 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.31 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.79 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  32.31 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.16 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3388  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.51 
 
 
290 aa  55.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530669  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.11 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  35.38 
 
 
647 aa  54.7  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.25 
 
 
174 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.51 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.93 
 
 
137 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6242  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.22 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937255  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1684  YeeE/YedE  45.28 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.51 
 
 
175 aa  51.2  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0328  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.2 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.76 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.440254  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  28.06 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2076  hypothetical protein  30.71 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1998  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.3 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  28.15 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3296  YeeE/YedE family protein  33.12 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  30 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  30.95 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0232  YeeE/YedE  29.1 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4037  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.67 
 
 
140 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.137449 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5569  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.71 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0380348  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1882  YeeE/YedE family membrane protein  32.32 
 
 
140 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  29.08 
 
 
143 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.61 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3556  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.65 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0437  hypothetical protein  32.26 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.275295 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.32 
 
 
140 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000103  predicted transporter component  34.41 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.72 
 
 
139 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1027  hypothetical protein  32.61 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645004  normal  0.157652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2717  putative transmembrane protein  46.3 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.430546  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.71 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  27.87 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01940  hypothetical protein  38.18 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1879  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.07 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.189213  normal  0.0138724 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0584  hypothetical protein  31.15 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1087  hypothetical protein  32.65 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.67 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 
189 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3333  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.48 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449155  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2496  integral membrane protein  29.07 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  32.5 
 
 
367 aa  44.7  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  27.13 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.85 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4147  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.46 
 
 
148 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46 
 
 
183 aa  44.7  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6794  hypothetical protein  32.39 
 
 
150 aa  43.9  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0357  YeeE/YedE family protein  37.31 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1402  YeeE/YedE family protein  37.31 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.218972  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1715  twin-arginine translocation pathway signal  40.74 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0204  hypothetical protein  37.31 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0939  hypothetical protein  37.31 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1898  hypothetical protein  37.31 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154613  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1617  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.96 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000235117  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0443  hypothetical protein  37.31 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4716  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.66 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1812  YeeE/YedE family protein  37.31 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.37 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05710  hypothetical protein  34.92 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0731  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.38 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.87 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1572  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0117  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.46 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0807973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.59 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1408  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.36 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2437  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.44 
 
 
140 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224187  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43350  predicted protein  31.43 
 
 
348 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4075  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.78 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135542  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1500  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.34 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2321  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  57.58 
 
 
152 aa  41.2  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  41.2  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  33.06 
 
 
189 aa  40.8  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  57.14 
 
 
149 aa  40.8  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.444029  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  28.12 
 
 
399 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>