59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1628 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  100 
 
 
185 aa  353  7.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  65.76 
 
 
186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  51.11 
 
 
185 aa  187  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  59.78 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.38 
 
 
175 aa  144  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.97 
 
 
197 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  48.47 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.33 
 
 
176 aa  130  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.1 
 
 
174 aa  128  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  48.12 
 
 
175 aa  121  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.62 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.21 
 
 
175 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  35.8 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  47.3 
 
 
173 aa  88.6  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  34.3 
 
 
419 aa  87  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  35.37 
 
 
237 aa  84.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  37.88 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  35.29 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  41.38 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  37.88 
 
 
399 aa  74.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.12 
 
 
218 aa  74.3  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  37.01 
 
 
647 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  34.43 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.77 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  30.94 
 
 
373 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.31 
 
 
218 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  36.17 
 
 
218 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.26 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.52 
 
 
352 aa  62.4  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  35.46 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  40.34 
 
 
344 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.64 
 
 
167 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  30.53 
 
 
137 aa  51.2  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.46 
 
 
157 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.37 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  30.77 
 
 
371 aa  47.8  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36 
 
 
345 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.73 
 
 
159 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30 
 
 
330 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.13 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.78 
 
 
332 aa  46.2  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.37 
 
 
137 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.61 
 
 
138 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  28.47 
 
 
141 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  27.88 
 
 
137 aa  45.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  32.5 
 
 
136 aa  44.7  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.77 
 
 
153 aa  44.7  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.09 
 
 
149 aa  44.7  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.27 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.7 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.53 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0328  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.37 
 
 
137 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3903  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.43 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0456636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  27.74 
 
 
141 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3333  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.41 
 
 
145 aa  42  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  27.13 
 
 
160 aa  42  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.25 
 
 
354 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.26 
 
 
140 aa  41.2  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>