53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1834 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 		 180 aa  352  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  74.86 
 
 		 183 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  44.59 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.06 
 
 		 174 aa  94.4  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.46 
 
 		 175 aa  94.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  36.24 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.78 
 
 		 176 aa  87.4  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  41.26 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.62 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.58 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.11 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  32.95 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 419 aa  70.9  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  35.34 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  32.61 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  37.12 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  32.17 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  35.34 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  38.46 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  31.79 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  32.06 
 
 		 647 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.86 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  25.57 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  28.29 
 
 		 359 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  28.29 
 
 		 359 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  27.33 
 
 		 399 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  25.48 
 
 		 186 aa  50.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  26.9 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.03 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  29.03 
 
 		 218 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.51 
 
 		 462 aa  48.5  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  28.49 
 
 		 218 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.3 
 
 		 407 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.24 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  31.46 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.34 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  37.36 
 
 		 344 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.59 
 
 		 352 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  25 
 
 		 404 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  27.27 
 
 		 344 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  34.12 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  24.42 
 
 		 404 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  24.42 
 
 		 404 aa  42.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.73 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30 
 
 		 332 aa  42.4  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  27.21 
 
 		 404 aa  42  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3646  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.78 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.415893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.46 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.62 
 
 		 153 aa  41.6  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5569  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.55 
 
 		 160 aa  40.8  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0380348  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28 
 
 		 330 aa  41.2  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>