53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0625 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  100 
 
 		 186 aa  359  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  65.76 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  50.81 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  55.19 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.62 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.99 
 
 		 185 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  45.71 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.13 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.34 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.71 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  47.4 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.66 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 		 419 aa  94.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  48.34 
 
 		 173 aa  91.3  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  41.94 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  41.03 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  38.75 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  34.81 
 
 		 647 aa  79  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.2 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  39.22 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  32.7 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.96 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.94 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  41.8 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.07 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  33.61 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  34.88 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  29.86 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.4 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  28.65 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  27.81 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.98 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  32.31 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.95 
 
 		 140 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.5 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.98 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  32.73 
 
 		 137 aa  49.7  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.67 
 
 		 138 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.91 
 
 		 138 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  30.63 
 
 		 344 aa  47.8  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  33.64 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.82 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.91 
 
 		 330 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.44 
 
 		 332 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  33.05 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2677  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.65 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.13 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  31.96 
 
 		 394 aa  42.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.61 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 153 aa  42  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.59 
 
 		 345 aa  41.2  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>