85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12638 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  266  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  68.61 
 
 
137 aa  193  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.47 
 
 
138 aa  154  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.74 
 
 
138 aa  147  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2677  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  52.8 
 
 
157 aa  142  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  52.34 
 
 
160 aa  140  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  53.28 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50.75 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.75 
 
 
159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.51 
 
 
152 aa  136  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.51 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0268  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52.21 
 
 
172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.66 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  30.95 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.29 
 
 
174 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.75 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  29.46 
 
 
140 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.46 
 
 
140 aa  57.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.75 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.82 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.1 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  32.77 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.25 
 
 
175 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3296  YeeE/YedE family protein  39.73 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  31.69 
 
 
143 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.51 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.3 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.28 
 
 
152 aa  52  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.05 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  30.53 
 
 
185 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  30.51 
 
 
185 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0335  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.63 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6794  hypothetical protein  28.46 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2447  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.95 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.04 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  29.69 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.1 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01940  hypothetical protein  38.71 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.91 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1998  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.32 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2076  hypothetical protein  26.32 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2717  putative transmembrane protein  33 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.430546  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  29.01 
 
 
373 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  31.97 
 
 
205 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3388  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.69 
 
 
290 aa  47.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530669  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.58 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.440254  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  33.64 
 
 
186 aa  47.4  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05710  hypothetical protein  33.06 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000103  predicted transporter component  38.36 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2496  integral membrane protein  32.5 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4716  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.32 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  23.48 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.64 
 
 
197 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0232  YeeE/YedE  31.19 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1879  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.74 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.189213  normal  0.0138724 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1898  hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0357  YeeE/YedE family protein  34.78 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1684  YeeE/YedE  30.12 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0939  hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0204  hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1812  YeeE/YedE family protein  34.78 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0443  hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1402  YeeE/YedE family protein  34.78 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.218972  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2900  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.87 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0437  hypothetical protein  31.43 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.275295 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0398  hypothetical protein  22.73 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1027  hypothetical protein  37.66 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645004  normal  0.157652 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6242  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.19 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937255  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4147  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.04 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.91 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3633  hypothetical protein  32.94 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0117  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.38 
 
 
149 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0807973 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.63 
 
 
139 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.21 
 
 
137 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.772873  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1087  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544428  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02370  conserved hypothetical protein  38.24 
 
 
348 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621696  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1572  hypothetical protein  27.59 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4623  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.910607  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0328  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.56 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.86 
 
 
183 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2078  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.38 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3333  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.73 
 
 
145 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3556  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.85 
 
 
140 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4037  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.85 
 
 
140 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.137449 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0458  hypothetical protein  21.97 
 
 
145 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>