106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4623 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4623  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 		 151 aa  285  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.910607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  60.29 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4147  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  64.41 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1684  YeeE/YedE  52.32 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0117  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  57.66 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0807973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  52.59 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5966  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  58.73 
 
 		 141 aa  140  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0130  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  59.26 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2321  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  60.47 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1336  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  60.16 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377918 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52.21 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.94 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  57.27 
 
 		 137 aa  133  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.772873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1617  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  54.48 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000235117  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.522142  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0312  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  62.93 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.38 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50.78 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2717  putative transmembrane protein  53.39 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.430546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1879  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 139 aa  130  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.189213  normal  0.0138724 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4037  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.79 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0328  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52.63 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3749  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52.76 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  55.47 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3556  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  47.06 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.89 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.129791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5569  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.33 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0380348  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1882  YeeE/YedE family membrane protein  47.41 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0437  hypothetical protein  53.44 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.275295 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4703  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.61 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3903  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.67 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0456636  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3296  YeeE/YedE family protein  46.53 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1301  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  60.48 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50.82 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0584  hypothetical protein  47.14 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  43.61 
 
 		 141 aa  123  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2900  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.66 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4716  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  54.55 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6794  hypothetical protein  49.62 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2076  hypothetical protein  52.71 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1998  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52.71 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1408  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.1 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  46.38 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2496  integral membrane protein  46.03 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  58.87 
 
 		 149 aa  120  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.444029  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1915  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.83 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0939  hypothetical protein  57.27 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  49.54 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0357  YeeE/YedE family protein  57.27 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1087  hypothetical protein  56.25 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1027  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645004  normal  0.157652 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2437  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  53.28 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0443  hypothetical protein  57.27 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0204  hypothetical protein  57.27 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1898  hypothetical protein  57.27 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154613  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1812  YeeE/YedE family protein  57.27 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1402  YeeE/YedE family protein  57.27 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.218972  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0232  YeeE/YedE  45.65 
 
 		 143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3646  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  47.62 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.415893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0335  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  57.14 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6242  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.66 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05710  hypothetical protein  47.62 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2078  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000103  predicted transporter component  42.86 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0458  hypothetical protein  52.03 
 
 		 145 aa  115  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1744  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.28 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157818 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3333  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.19 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449155  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0398  hypothetical protein  52.03 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  45.67 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2447  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  54.55 
 
 		 142 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3017  hypothetical protein  43.51 
 
 		 161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.61 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2349  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.09 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2518  hypothetical protein  41.67 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3633  hypothetical protein  45.45 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3725  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.97 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905098  normal  0.214665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01940  hypothetical protein  50.89 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0960  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.61 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1572  hypothetical protein  48.7 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2817  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.25 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0393902  normal  0.331384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2106  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40 
 
 		 157 aa  103  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.653273  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0856  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.77 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000840369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.86 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.440254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1715  twin-arginine translocation pathway signal  51.82 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43350  predicted protein  40.3 
 
 		 348 aa  88.6  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0731  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.96 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27411  Conserved hypothetical  40.3 
 
 		 392 aa  85.1  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27482  predicted protein  40.3 
 
 		 338 aa  85.1  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15578  predicted protein  39.1 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.96534  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02370  conserved hypothetical protein  41.32 
 
 		 348 aa  80.9  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4075  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.59 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135542  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45.95 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.27 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.3 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.62 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.379116  hitchhiker  0.00015197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  40.19 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.64 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3388  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.54 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.82 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>