106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2996 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
138 aa  276  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  62.32 
 
 
138 aa  191  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  58.39 
 
 
137 aa  168  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  60.43 
 
 
136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  55.47 
 
 
137 aa  154  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.09 
 
 
152 aa  153  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  52.34 
 
 
160 aa  150  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.11 
 
 
159 aa  149  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52.21 
 
 
159 aa  147  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2677  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  53.6 
 
 
157 aa  147  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52.55 
 
 
167 aa  147  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0268  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.39 
 
 
172 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  37.21 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.03 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.03 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  28.99 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.97 
 
 
174 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.3 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.82 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0232  YeeE/YedE  29.1 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.23 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.85 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1882  YeeE/YedE family membrane protein  32.32 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3556  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.67 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4037  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.67 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.137449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1027  hypothetical protein  34.48 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645004  normal  0.157652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.5 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.5 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  31.09 
 
 
205 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2076  hypothetical protein  29.23 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1998  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.23 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6242  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937255  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.06 
 
 
149 aa  53.5  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  29.5 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  28 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.28 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.78 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.55 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  30.33 
 
 
186 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  29.41 
 
 
356 aa  50.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.01 
 
 
152 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  28.24 
 
 
373 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0437  hypothetical protein  29.03 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.275295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6794  hypothetical protein  40.35 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.05 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0328  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.28 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3388  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.62 
 
 
290 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530669  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0939  hypothetical protein  36.23 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0357  YeeE/YedE family protein  36.23 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1087  hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544428  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4716  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.03 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2437  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.32 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224187  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0443  hypothetical protein  36.23 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0204  hypothetical protein  36.23 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1898  hypothetical protein  36.23 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154613  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1812  YeeE/YedE family protein  36.23 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1402  YeeE/YedE family protein  36.23 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.218972  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  31.67 
 
 
186 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1408  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.2 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5569  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.29 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0380348  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  28.57 
 
 
352 aa  48.1  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2900  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.5 
 
 
162 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 
647 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000103  predicted transporter component  26.23 
 
 
152 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  23.66 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2717  putative transmembrane protein  26.88 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.430546  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  25.19 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01940  hypothetical protein  28.95 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3903  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0456636  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  25.19 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.35 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.440254  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2496  integral membrane protein  25.17 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  27.61 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3749  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.24 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30 
 
 
197 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.46 
 
 
183 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  27.61 
 
 
175 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4075  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.33 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135542  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2106  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.61 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.653273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  28.12 
 
 
185 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.56 
 
 
423 aa  43.5  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  26.89 
 
 
352 aa  43.5  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  28.57 
 
 
367 aa  43.5  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3296  YeeE/YedE family protein  38.46 
 
 
159 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1617  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.89 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000235117  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0584  hypothetical protein  27.61 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3333  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.84 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  24.81 
 
 
237 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0312  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.25 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1715  twin-arginine translocation pathway signal  32.94 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.5 
 
 
354 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0856  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.38 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000840369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.522142  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3725  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.26 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905098  normal  0.214665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0731  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.93 
 
 
156 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  28.36 
 
 
419 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2078  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.41 
 
 
144 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1572  hypothetical protein  30.48 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02370  conserved hypothetical protein  50 
 
 
348 aa  40.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>