121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0313 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 		 137 aa  254  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0328  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  98.54 
 
 		 137 aa  250  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0437  hypothetical protein  79.56 
 
 		 137 aa  202  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.275295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0232  YeeE/YedE  75.56 
 
 		 143 aa  199  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  72.26 
 
 		 143 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6242  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  77.37 
 
 		 151 aa  187  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1027  hypothetical protein  76 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645004  normal  0.157652 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  71.97 
 
 		 140 aa  186  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.129791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  73.72 
 
 		 143 aa  186  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4037  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  71.97 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1882  YeeE/YedE family membrane protein  69.7 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  67.15 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3556  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  71.21 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  65.15 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4716  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  67.65 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2717  putative transmembrane protein  70 
 
 		 145 aa  159  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.430546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1684  YeeE/YedE  61.31 
 
 		 168 aa  159  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5569  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  67.15 
 
 		 160 aa  157  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0380348  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2437  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  62.22 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1408  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  61.48 
 
 		 140 aa  153  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1087  hypothetical protein  68.1 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544428  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0939  hypothetical protein  70.69 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0357  YeeE/YedE family protein  70.69 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0443  hypothetical protein  70.69 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0204  hypothetical protein  70.69 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1898  hypothetical protein  70.69 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154613  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1812  YeeE/YedE family protein  70.69 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1402  YeeE/YedE family protein  70.69 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.218972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1879  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  58.96 
 
 		 139 aa  147  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.189213  normal  0.0138724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  51.13 
 
 		 140 aa  144  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.13 
 
 		 140 aa  143  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1617  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  57.66 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000235117  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  60 
 
 		 148 aa  140  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3296  YeeE/YedE family protein  58.78 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3749  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.49 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  52.21 
 
 		 141 aa  137  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4147  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  59.13 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01940  hypothetical protein  60.34 
 
 		 139 aa  133  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.51 
 
 		 139 aa  133  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4623  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  53.38 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.910607  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5966  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.2 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0117  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  59.84 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0807973 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3903  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.36 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0456636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6794  hypothetical protein  56.06 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1336  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.56 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377918 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3633  hypothetical protein  49.26 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  43.8 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0856  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000840369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2447  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  62.83 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.79 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.522142  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0335  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  56.9 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0130  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  60 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0398  hypothetical protein  51.13 
 
 		 145 aa  123  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  42.34 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2106  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.28 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.653273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2321  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  59.13 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05710  hypothetical protein  52 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0458  hypothetical protein  50.38 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0312  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.17 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2518  hypothetical protein  48.51 
 
 		 145 aa  119  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4703  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50.75 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3333  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.67 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449155  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2900  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  52.99 
 
 		 162 aa  116  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000103  predicted transporter component  51.64 
 
 		 152 aa  116  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.82 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2078  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.84 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1998  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.97 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1572  hypothetical protein  52.1 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2076  hypothetical protein  46.97 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3646  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.83 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.415893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1915  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.97 
 
 		 163 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.12 
 
 		 137 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.772873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2349  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.03 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0584  hypothetical protein  46.72 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2817  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.67 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0393902  normal  0.331384 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3725  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45.59 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905098  normal  0.214665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1301  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  58.93 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  62.64 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.444029  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1744  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.03 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157818 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2496  integral membrane protein  41.48 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3017  hypothetical protein  45.74 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1715  twin-arginine translocation pathway signal  51.26 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  57.52 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.440254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0960  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.31 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27411  Conserved hypothetical  46.61 
 
 		 392 aa  89.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27482  predicted protein  46.61 
 
 		 338 aa  89.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43350  predicted protein  39.1 
 
 		 348 aa  86.3  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0731  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.64 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15578  predicted protein  42.96 
 
 		 348 aa  84  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.96534  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4075  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.89 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135542  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02370  conserved hypothetical protein  39.32 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621696  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.2 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.52 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.85 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  35.07 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.67 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.379116  hitchhiker  0.00015197 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5808  sulphate transporter  56.36 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125757  normal  0.376579 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.66 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.28 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>