105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3725 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3725  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905098  normal  0.214665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4075  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.49 
 
 		 161 aa  160  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135542  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0731  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  59.5 
 
 		 156 aa  153  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000103  predicted transporter component  50 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2106  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.94 
 
 		 157 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.653273  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0584  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05710  hypothetical protein  46.36 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2496  integral membrane protein  44.76 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6794  hypothetical protein  38.93 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1617  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.86 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000235117  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.57 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.93 
 
 		 137 aa  113  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.772873  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5966  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.66 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0117  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.62 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0807973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1336  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.45 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377918 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1684  YeeE/YedE  45.59 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3017  hypothetical protein  39.16 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  42.67 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3633  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1879  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.06 
 
 		 139 aa  111  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.189213  normal  0.0138724 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4703  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.55 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.83 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.72 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3903  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.67 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0456636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0130  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.84 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4623  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.97 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.910607  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3646  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.16 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.415893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.59 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.36 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3296  YeeE/YedE family protein  41.84 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3333  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.07 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449155  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  41.35 
 
 		 141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0458  hypothetical protein  43.06 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2437  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.17 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0398  hypothetical protein  43.75 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0232  YeeE/YedE  42.57 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.94 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3749  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.75 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  41.35 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1915  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.93 
 
 		 163 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4716  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.88 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2518  hypothetical protein  39.73 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1408  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.17 
 
 		 140 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1998  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.43 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0328  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.85 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2076  hypothetical protein  41.61 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4147  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.09 
 
 		 148 aa  104  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.88 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.129791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4037  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.55 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1882  YeeE/YedE family membrane protein  42.03 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  43.17 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2817  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.67 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0393902  normal  0.331384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3556  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.85 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.45 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.5 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.14 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1744  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.19 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2321  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.31 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1027  hypothetical protein  41.13 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645004  normal  0.157652 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6242  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.8 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0312  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.86 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.08 
 
 		 139 aa  99  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.522142  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5569  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.84 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0380348  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0437  hypothetical protein  41.91 
 
 		 137 aa  97.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.275295 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0856  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.61 
 
 		 149 aa  97.4  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000840369 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2349  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.85 
 
 		 161 aa  97.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2900  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.13 
 
 		 162 aa  97.1  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2078  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.03 
 
 		 144 aa  97.1  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0335  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.15 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2717  putative transmembrane protein  38.89 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.430546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1301  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.47 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.4 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43350  predicted protein  35.54 
 
 		 348 aa  88.2  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15578  predicted protein  40.46 
 
 		 348 aa  88.2  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.96534  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0939  hypothetical protein  41.74 
 
 		 140 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0357  YeeE/YedE family protein  41.74 
 
 		 140 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0443  hypothetical protein  41.74 
 
 		 140 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0204  hypothetical protein  41.74 
 
 		 140 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1898  hypothetical protein  41.74 
 
 		 140 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154613  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1812  YeeE/YedE family protein  41.74 
 
 		 140 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1402  YeeE/YedE family protein  41.74 
 
 		 140 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.218972  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1715  twin-arginine translocation pathway signal  41.18 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.41 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.444029  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1087  hypothetical protein  39.34 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01940  hypothetical protein  39.13 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2447  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.32 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1572  hypothetical protein  39.53 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27411  Conserved hypothetical  37.19 
 
 		 392 aa  80.5  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27482  predicted protein  39.13 
 
 		 338 aa  80.5  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02370  conserved hypothetical protein  33.94 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621696  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0960  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.59 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.74 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.440254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.01 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.18 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.61 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  29.49 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3388  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.05 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.23 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.92 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.54 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>